63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3821 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3821  Pectate lyase/Amb allergen  100 
 
 		 456 aa  934    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0153  pectate lyase/Amb allergen  44.8 
 
 		 449 aa  344  1e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5013  Pectate lyase/Amb allergen  47.04 
 
 		 427 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  46.03 
 
 		 730 aa  332  7.000000000000001e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1493  pectate lyase  47.47 
 
 		 435 aa  327  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1087  pectate lyase/Amb allergen  49.11 
 
 		 436 aa  316  6e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0821757  hitchhiker  0.00617992 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0495  Pectate lyase/Amb allergen  43.39 
 
 		 427 aa  292  8e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.016328 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0132  Pectate lyase/Amb allergen  35.64 
 
 		 505 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1178  Pectate lyase/Amb allergen  37.34 
 
 		 498 aa  223  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000219225 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6139  Pectate lyase  37.46 
 
 		 380 aa  207  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3434  Pectate lyase/Amb allergen  37.19 
 
 		 504 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1089  Pectate lyase/Amb allergen  35.51 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1090  Pectate lyase/Amb allergen  32.11 
 
 		 405 aa  196  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2863  Pectate lyase/Amb allergen  33.08 
 
 		 522 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.707547  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2764  Pectate lyase/Amb allergen  30.86 
 
 		 402 aa  190  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02650  pectate lyase  35.75 
 
 		 346 aa  188  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1091  Pectate lyase/Amb allergen  33.7 
 
 		 392 aa  187  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2763  Pectate lyase/Amb allergen  32.76 
 
 		 397 aa  186  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1848  Pectate lyase/Amb allergen  34.5 
 
 		 317 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  39.08 
 
 		 482 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2436  Pectate lyase/Amb allergen  31.37 
 
 		 327 aa  103  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00169439  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0511  Pectate lyase/Amb allergen  30.95 
 
 		 365 aa  98.2  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000797817  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0430  Pectate lyase/Amb allergen  32.96 
 
 		 335 aa  93.6  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202776  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  29.3 
 
 		 486 aa  90.1  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07646  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVN4]  32.6 
 
 		 327 aa  90.1  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3448  Pectate lyase-like  30.26 
 
 		 594 aa  88.6  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372442  hitchhiker  0.00149155 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0435  Pectate lyase/Amb allergen  25.78 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.017738  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0537  Pectate lyase/Amb allergen  30.29 
 
 		 351 aa  82  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  29.1 
 
 		 527 aa  81.6  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00741  Pectate lyase Precursor (EC 4.2.2.2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00645]  33.33 
 
 		 326 aa  79.7  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2941  Pectate lyase/Amb allergen  32.22 
 
 		 501 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2566  Pectate lyase/Amb allergen  29.8 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  27.57 
 
 		 991 aa  77.8  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  26.51 
 
 		 922 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  26.67 
 
 		 686 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  28.44 
 
 		 554 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0280  AAA ATPase family protein  26.75 
 
 		 272 aa  72.8  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.582677  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1231  Pectate lyase/Amb allergen  28.08 
 
 		 919 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218309  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  26.92 
 
 		 462 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2168  pectate lyase  29.07 
 
 		 512 aa  69.3  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.108445  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3958  Pectate lyase/Amb allergen  27.32 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  26.24 
 
 		 1409 aa  65.1  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3378  Pectate lyase/Amb allergen  28.57 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  30.51 
 
 		 794 aa  63.9  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0353  Pectate lyase/Amb allergen  33.15 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  29.83 
 
 		 474 aa  63.2  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  24.72 
 
 		 1316 aa  60.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0352  Pectate lyase/Amb allergen  29.35 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  24.16 
 
 		 769 aa  60.1  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0271  Pectate lyase/Amb allergen  32.2 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1371  Pectate lyase/Amb allergen  27.35 
 
 		 314 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00120054  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3306  Pectate lyase/Amb allergen  28.49 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1777  Pectate lyase/Amb allergen  26.46 
 
 		 314 aa  57  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4035  Pectate lyase/Amb allergen  36.94 
 
 		 374 aa  57  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0270  Pectate lyase/Amb allergen  29.12 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3859  Pectate lyase/Amb allergen  35.9 
 
 		 374 aa  55.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3858  Pectate lyase/Amb allergen  36.04 
 
 		 374 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4036  Pectate lyase/Amb allergen  34.19 
 
 		 374 aa  53.5  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4037  Pectate lyase/Amb allergen  34.48 
 
 		 374 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3860  Pectate lyase/Amb allergen  33.62 
 
 		 374 aa  50.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0281  hypothetical protein  38.46 
 
 		 143 aa  49.7  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.342666  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3839  type III helper protein HopAK1  23.95 
 
 		 543 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7394  Pectate lyase/Amb allergen  27.13 
 
 		 398 aa  47  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0906839  normal  0.447007 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>