34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3306 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3306  Pectate lyase/Amb allergen  100 
 
 		 305 aa  629  1e-179  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1371  Pectate lyase/Amb allergen  49.39 
 
 		 314 aa  236  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00120054  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1777  Pectate lyase/Amb allergen  48.18 
 
 		 314 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3378  Pectate lyase/Amb allergen  43.11 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3839  type III helper protein HopAK1  39.58 
 
 		 543 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4101  type III helper protein HopAK1  39.2 
 
 		 555 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00741  Pectate lyase Precursor (EC 4.2.2.2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00645]  27.39 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0511  Pectate lyase/Amb allergen  29.33 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000797817  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0430  Pectate lyase/Amb allergen  29.33 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202776  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1089  Pectate lyase/Amb allergen  24.39 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0153  pectate lyase/Amb allergen  28.77 
 
 		 449 aa  64.7  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07646  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVN4]  26.56 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6139  Pectate lyase  24.83 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0537  Pectate lyase/Amb allergen  28.14 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1091  Pectate lyase/Amb allergen  26.28 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3821  Pectate lyase/Amb allergen  28.49 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2764  Pectate lyase/Amb allergen  23.79 
 
 		 402 aa  55.8  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429805  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  25.21 
 
 		 686 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2863  Pectate lyase/Amb allergen  29.41 
 
 		 522 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.707547  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0495  Pectate lyase/Amb allergen  28.43 
 
 		 427 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.016328 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  25.44 
 
 		 486 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2763  Pectate lyase/Amb allergen  23.6 
 
 		 397 aa  52  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2436  Pectate lyase/Amb allergen  27.43 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00169439  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1848  Pectate lyase/Amb allergen  27.72 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  25.62 
 
 		 554 aa  50.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1178  Pectate lyase/Amb allergen  26.13 
 
 		 498 aa  49.3  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000219225 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  23.73 
 
 		 991 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1087  pectate lyase/Amb allergen  23.81 
 
 		 436 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0821757  hitchhiker  0.00617992 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02650  pectate lyase  22.3 
 
 		 346 aa  48.5  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1090  Pectate lyase/Amb allergen  23.33 
 
 		 405 aa  45.4  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0435  Pectate lyase/Amb allergen  22.3 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.017738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1493  pectate lyase  24.52 
 
 		 435 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  27.51 
 
 		 482 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  24.31 
 
 		 527 aa  44.3  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>