68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0537 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0537  Pectate lyase/Amb allergen  100 
 
 		 351 aa  689    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2436  Pectate lyase/Amb allergen  38.13 
 
 		 327 aa  169  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00169439  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1848  Pectate lyase/Amb allergen  38.46 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  41.22 
 
 		 482 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  32.07 
 
 		 686 aa  140  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0435  Pectate lyase/Amb allergen  32.81 
 
 		 375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.017738  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0430  Pectate lyase/Amb allergen  30.71 
 
 		 335 aa  129  8.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202776  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0511  Pectate lyase/Amb allergen  35.34 
 
 		 365 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000797817  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  31.19 
 
 		 554 aa  122  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  31.92 
 
 		 486 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1493  pectate lyase  34.06 
 
 		 435 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  26.2 
 
 		 794 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00741  Pectate lyase Precursor (EC 4.2.2.2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00645]  32.7 
 
 		 326 aa  96.7  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  26.16 
 
 		 527 aa  96.3  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  25.48 
 
 		 474 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2764  Pectate lyase/Amb allergen  25.55 
 
 		 402 aa  91.3  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429805  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0153  pectate lyase/Amb allergen  32.08 
 
 		 449 aa  90.5  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1231  Pectate lyase/Amb allergen  30.3 
 
 		 919 aa  90.9  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218309  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1090  Pectate lyase/Amb allergen  25.61 
 
 		 405 aa  90.5  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5013  Pectate lyase/Amb allergen  33.5 
 
 		 427 aa  90.1  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1089  Pectate lyase/Amb allergen  26.78 
 
 		 385 aa  87.4  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07646  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVN4]  29.92 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1087  pectate lyase/Amb allergen  32.69 
 
 		 436 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0821757  hitchhiker  0.00617992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  32.84 
 
 		 730 aa  84  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0495  Pectate lyase/Amb allergen  31.84 
 
 		 427 aa  82.8  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.016328 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  25.93 
 
 		 1316 aa  82.8  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3821  Pectate lyase/Amb allergen  30.29 
 
 		 456 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  26.32 
 
 		 462 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2941  Pectate lyase/Amb allergen  27.59 
 
 		 501 aa  79.3  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  23.28 
 
 		 922 aa  79  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  30.08 
 
 		 1409 aa  79  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6139  Pectate lyase  27.79 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1091  Pectate lyase/Amb allergen  22.59 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2763  Pectate lyase/Amb allergen  25.68 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1178  Pectate lyase/Amb allergen  30.61 
 
 		 498 aa  76.6  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000219225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3958  Pectate lyase/Amb allergen  25.54 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  25.17 
 
 		 769 aa  75.1  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2168  pectate lyase  25.61 
 
 		 512 aa  73.9  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.108445  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0132  Pectate lyase/Amb allergen  35.34 
 
 		 505 aa  73.6  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3839  type III helper protein HopAK1  26.26 
 
 		 543 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02650  pectate lyase  26 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  23.26 
 
 		 991 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2863  Pectate lyase/Amb allergen  27.36 
 
 		 522 aa  70.5  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.707547  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3985  Pectate lyase/Amb allergen  28.51 
 
 		 421 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971043  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4283  pectin lyase  31.28 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04882  pectin lyase (Eurofung)  29.52 
 
 		 464 aa  65.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.485233 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1371  Pectate lyase/Amb allergen  29.6 
 
 		 314 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00120054  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3434  Pectate lyase/Amb allergen  27.69 
 
 		 504 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1777  Pectate lyase/Amb allergen  29.15 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02331  Pectin lyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU6]  31.53 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.37768  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4101  type III helper protein HopAK1  25.72 
 
 		 555 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3448  Pectate lyase-like  24.79 
 
 		 594 aa  63.2  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372442  hitchhiker  0.00149155 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09439  pectin lyase (Eurofung)  29.9 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02569  Pectin lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA61]  31.82 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3378  Pectate lyase/Amb allergen  27.17 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3306  Pectate lyase/Amb allergen  27.66 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0352  Pectate lyase/Amb allergen  24.42 
 
 		 375 aa  53.1  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10147  conserved hypothetical protein  26.5 
 
 		 387 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.705837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0281  hypothetical protein  31.71 
 
 		 143 aa  50.8  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.342666  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0271  Pectate lyase/Amb allergen  24.42 
 
 		 375 aa  50.4  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0270  Pectate lyase/Amb allergen  23.26 
 
 		 375 aa  50.1  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4035  Pectate lyase/Amb allergen  26.16 
 
 		 374 aa  49.7  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3860  Pectate lyase/Amb allergen  23.85 
 
 		 374 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0353  Pectate lyase/Amb allergen  24.42 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3858  Pectate lyase/Amb allergen  25 
 
 		 374 aa  47.4  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4037  Pectate lyase/Amb allergen  22.75 
 
 		 374 aa  47  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3881  Pectate lyase-like  26.52 
 
 		 747 aa  43.9  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000360789  normal  0.117799 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4036  Pectate lyase/Amb allergen  25.79 
 
 		 374 aa  43.1  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>