59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4037 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4037  Pectate lyase/Amb allergen  100 
 
 		 374 aa  768    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3858  Pectate lyase/Amb allergen  84.45 
 
 		 374 aa  634    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3859  Pectate lyase/Amb allergen  83.65 
 
 		 374 aa  640    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3860  Pectate lyase/Amb allergen  95.19 
 
 		 374 aa  704    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4035  Pectate lyase/Amb allergen  83.91 
 
 		 374 aa  630  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4036  Pectate lyase/Amb allergen  83.11 
 
 		 374 aa  615  1e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0270  Pectate lyase/Amb allergen  76.47 
 
 		 375 aa  597  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0353  Pectate lyase/Amb allergen  74.73 
 
 		 376 aa  587  1e-166  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0271  Pectate lyase/Amb allergen  74.33 
 
 		 375 aa  568  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0352  Pectate lyase/Amb allergen  74.13 
 
 		 375 aa  556  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  37.41 
 
 		 1316 aa  139  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  36.97 
 
 		 769 aa  136  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3448  Pectate lyase-like  33.7 
 
 		 594 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372442  hitchhiker  0.00149155 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2941  Pectate lyase/Amb allergen  34.88 
 
 		 501 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  33.33 
 
 		 922 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3958  Pectate lyase/Amb allergen  31.29 
 
 		 365 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2168  pectate lyase  32.74 
 
 		 512 aa  124  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.108445  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2436  Pectate lyase/Amb allergen  33.46 
 
 		 327 aa  110  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00169439  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  28.73 
 
 		 462 aa  109  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  32.21 
 
 		 527 aa  109  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0430  Pectate lyase/Amb allergen  29.69 
 
 		 335 aa  97.8  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202776  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1848  Pectate lyase/Amb allergen  31.15 
 
 		 317 aa  96.7  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  29.47 
 
 		 1409 aa  94.4  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  30.6 
 
 		 482 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07646  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVN4]  28.99 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1231  Pectate lyase/Amb allergen  28.85 
 
 		 919 aa  86.3  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218309  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1089  Pectate lyase/Amb allergen  31.18 
 
 		 385 aa  86.3  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00741  Pectate lyase Precursor (EC 4.2.2.2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00645]  32.2 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2763  Pectate lyase/Amb allergen  25.57 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5013  Pectate lyase/Amb allergen  30.96 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1090  Pectate lyase/Amb allergen  29.09 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6139  Pectate lyase  27.27 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2764  Pectate lyase/Amb allergen  37.17 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429805  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  30.6 
 
 		 794 aa  66.6  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0511  Pectate lyase/Amb allergen  30.3 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000797817  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  30.6 
 
 		 474 aa  66.6  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1087  pectate lyase/Amb allergen  28.57 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0821757  hitchhiker  0.00617992 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  32.69 
 
 		 554 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1493  pectate lyase  26.95 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0435  Pectate lyase/Amb allergen  28.57 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.017738  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1091  Pectate lyase/Amb allergen  26.04 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0153  pectate lyase/Amb allergen  27.23 
 
 		 449 aa  60.5  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  24.43 
 
 		 686 aa  60.1  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3881  Pectate lyase-like  28.49 
 
 		 747 aa  59.3  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000360789  normal  0.117799 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02650  pectate lyase  27.82 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  34.82 
 
 		 730 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2863  Pectate lyase/Amb allergen  29.71 
 
 		 522 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.707547  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  25.21 
 
 		 486 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3821  Pectate lyase/Amb allergen  34.48 
 
 		 456 aa  53.1  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0132  Pectate lyase/Amb allergen  31.58 
 
 		 505 aa  50.1  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  26.19 
 
 		 991 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2566  Pectate lyase/Amb allergen  25.89 
 
 		 368 aa  47.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3434  Pectate lyase/Amb allergen  25.26 
 
 		 504 aa  47  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0281  hypothetical protein  28.39 
 
 		 143 aa  46.6  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.342666  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0537  Pectate lyase/Amb allergen  22.75 
 
 		 351 aa  46.2  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0495  Pectate lyase/Amb allergen  25.71 
 
 		 427 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.016328 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1777  Pectate lyase/Amb allergen  26.48 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3985  Pectate lyase/Amb allergen  25.93 
 
 		 421 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1178  Pectate lyase/Amb allergen  23.37 
 
 		 498 aa  43.9  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000219225 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>