80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0430 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0430  Pectate lyase/Amb allergen  100 
 
 		 335 aa  683    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202776  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  41.91 
 
 		 527 aa  178  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0511  Pectate lyase/Amb allergen  35.45 
 
 		 365 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000797817  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2436  Pectate lyase/Amb allergen  39.86 
 
 		 327 aa  159  7e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00169439  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0435  Pectate lyase/Amb allergen  33.16 
 
 		 375 aa  158  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.017738  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  39.02 
 
 		 462 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07646  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVN4]  40.47 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3448  Pectate lyase-like  35.67 
 
 		 594 aa  157  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372442  hitchhiker  0.00149155 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  39.75 
 
 		 922 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1848  Pectate lyase/Amb allergen  35.11 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00741  Pectate lyase Precursor (EC 4.2.2.2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00645]  40.47 
 
 		 326 aa  149  9e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  33.56 
 
 		 769 aa  146  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  32.45 
 
 		 1316 aa  143  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2941  Pectate lyase/Amb allergen  33.99 
 
 		 501 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3958  Pectate lyase/Amb allergen  34.81 
 
 		 365 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  34.27 
 
 		 794 aa  139  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  32.09 
 
 		 686 aa  136  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0537  Pectate lyase/Amb allergen  31.58 
 
 		 351 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2168  pectate lyase  32.65 
 
 		 512 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.108445  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  34.04 
 
 		 482 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  32.04 
 
 		 474 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1089  Pectate lyase/Amb allergen  35.63 
 
 		 385 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  32.44 
 
 		 1409 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2763  Pectate lyase/Amb allergen  34.98 
 
 		 397 aa  116  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  34.33 
 
 		 730 aa  115  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5013  Pectate lyase/Amb allergen  34.43 
 
 		 427 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0153  pectate lyase/Amb allergen  33.98 
 
 		 449 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1090  Pectate lyase/Amb allergen  33.08 
 
 		 405 aa  109  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1493  pectate lyase  33.5 
 
 		 435 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  32.18 
 
 		 486 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1231  Pectate lyase/Amb allergen  32.37 
 
 		 919 aa  105  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218309  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2764  Pectate lyase/Amb allergen  28.9 
 
 		 402 aa  103  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429805  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4036  Pectate lyase/Amb allergen  33.5 
 
 		 374 aa  102  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1087  pectate lyase/Amb allergen  34.16 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0821757  hitchhiker  0.00617992 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02650  pectate lyase  28.45 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6139  Pectate lyase  28.57 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4035  Pectate lyase/Amb allergen  32.37 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  32.14 
 
 		 554 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1091  Pectate lyase/Amb allergen  27.72 
 
 		 392 aa  100  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3859  Pectate lyase/Amb allergen  32 
 
 		 374 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0270  Pectate lyase/Amb allergen  29.52 
 
 		 375 aa  99.4  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3858  Pectate lyase/Amb allergen  29.1 
 
 		 374 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0352  Pectate lyase/Amb allergen  32.08 
 
 		 375 aa  98.6  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2863  Pectate lyase/Amb allergen  29.91 
 
 		 522 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.707547  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4037  Pectate lyase/Amb allergen  29.69 
 
 		 374 aa  97.8  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0353  Pectate lyase/Amb allergen  31.4 
 
 		 376 aa  95.9  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0271  Pectate lyase/Amb allergen  29.69 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3860  Pectate lyase/Amb allergen  29.76 
 
 		 374 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0495  Pectate lyase/Amb allergen  30.2 
 
 		 427 aa  93.6  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.016328 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3821  Pectate lyase/Amb allergen  32.96 
 
 		 456 aa  94  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1371  Pectate lyase/Amb allergen  31.28 
 
 		 314 aa  89  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00120054  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1777  Pectate lyase/Amb allergen  31.28 
 
 		 314 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1178  Pectate lyase/Amb allergen  27.98 
 
 		 498 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000219225 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0132  Pectate lyase/Amb allergen  28.16 
 
 		 505 aa  77.4  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  28.15 
 
 		 991 aa  77.4  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3434  Pectate lyase/Amb allergen  27.69 
 
 		 504 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3839  type III helper protein HopAK1  26.67 
 
 		 543 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3378  Pectate lyase/Amb allergen  31.02 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3985  Pectate lyase/Amb allergen  27.86 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971043  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4283  pectin lyase  27.48 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2566  Pectate lyase/Amb allergen  29.84 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0281  hypothetical protein  32.19 
 
 		 143 aa  62  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.342666  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4101  type III helper protein HopAK1  25.42 
 
 		 555 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3306  Pectate lyase/Amb allergen  28.96 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04882  pectin lyase (Eurofung)  25.77 
 
 		 464 aa  59.3  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.485233 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3881  Pectate lyase-like  27.47 
 
 		 747 aa  55.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000360789  normal  0.117799 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0280  AAA ATPase family protein  34.74 
 
 		 272 aa  55.8  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.582677  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02331  Pectin lyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU6]  25 
 
 		 392 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.37768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  25.52 
 
 		 682 aa  53.5  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10147  conserved hypothetical protein  25.73 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.705837  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09439  pectin lyase (Eurofung)  26.99 
 
 		 377 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02569  Pectin lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA61]  26.84 
 
 		 379 aa  50.1  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3040  pectate lyase  33.59 
 
 		 459 aa  49.3  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00328566  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7394  Pectate lyase/Amb allergen  23.01 
 
 		 398 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0906839  normal  0.447007 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0948  hypothetical protein  27.54 
 
 		 473 aa  46.6  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.289629  hitchhiker  0.0000199751 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  26.21 
 
 		 770 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  46.81 
 
 		 528 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  24.91 
 
 		 772 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4281  pectate lyase  24.77 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.07 
 
 		 1063 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>