38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0948 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0948  hypothetical protein  100 
 
 		 473 aa  976    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.289629  hitchhiker  0.0000199751 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  36.77 
 
 		 770 aa  248  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  36.99 
 
 		 772 aa  245  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0772  hypothetical protein  35.97 
 
 		 1023 aa  236  4e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4281  pectate lyase  34.77 
 
 		 454 aa  226  7e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  35.1 
 
 		 682 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4098  hypothetical protein  33.68 
 
 		 819 aa  196  7e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0136956  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0236  hypothetical protein  34.43 
 
 		 498 aa  196  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2788  hypothetical protein  32.19 
 
 		 541 aa  189  7e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2792  hypothetical protein  34.24 
 
 		 843 aa  187  5e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.66343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1802  hypothetical protein  31.66 
 
 		 701 aa  186  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0034444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2795  hypothetical protein  30.86 
 
 		 551 aa  179  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4093  hypothetical protein  31.25 
 
 		 570 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00468753  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4091  hypothetical protein  30.63 
 
 		 568 aa  173  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  33.01 
 
 		 999 aa  172  7.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2456  hypothetical protein  32.85 
 
 		 924 aa  170  6e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2151  hypothetical protein  30.58 
 
 		 565 aa  167  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00303594  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05333  pectate lyase (Eurofung)  41.41 
 
 		 421 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  32.83 
 
 		 593 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1517  pectate lyase  32.87 
 
 		 450 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.188237  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4572  hypothetical protein  28.74 
 
 		 537 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.93 
 
 		 1063 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3040  pectate lyase  30.7 
 
 		 459 aa  124  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00328566  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0351  pectate lyase  35.58 
 
 		 421 aa  124  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0269  pectate lyase  27.54 
 
 		 421 aa  117  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.529079  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  31.3 
 
 		 1031 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4783  hypothetical protein  33.98 
 
 		 701 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.292143  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4038  pectate lyase  32.39 
 
 		 425 aa  109  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3861  pectate lyase  32.95 
 
 		 431 aa  107  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4785  hypothetical protein  33.33 
 
 		 467 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.375184  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4789  hypothetical protein  29.46 
 
 		 710 aa  97.4  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.148662  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3519  hypothetical protein  29.88 
 
 		 446 aa  97.1  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2307  pectate lyase  30.27 
 
 		 425 aa  96.3  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00284023 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0937  ribosomal protein L24  26.23 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761508 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  25.88 
 
 		 566 aa  70.5  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2397  PKD domain containing protein  25.24 
 
 		 670 aa  65.1  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.861546  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0356  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1011 aa  63.2  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161093  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09367  conserved hypothetical protein  46.32 
 
 		 314 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.477397  hitchhiker  0.00611411 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>