69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0435 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0435  Pectate lyase/Amb allergen  100 
 
 		 375 aa  766    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.017738  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1848  Pectate lyase/Amb allergen  36.43 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0511  Pectate lyase/Amb allergen  31.78 
 
 		 365 aa  143  5e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000797817  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0430  Pectate lyase/Amb allergen  32.9 
 
 		 335 aa  140  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202776  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2436  Pectate lyase/Amb allergen  35 
 
 		 327 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00169439  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0537  Pectate lyase/Amb allergen  33.12 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  33.44 
 
 		 482 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  32.67 
 
 		 527 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  31.25 
 
 		 462 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  34.09 
 
 		 554 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  29.17 
 
 		 686 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1090  Pectate lyase/Amb allergen  29.21 
 
 		 405 aa  99  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  30.77 
 
 		 486 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1089  Pectate lyase/Amb allergen  29.79 
 
 		 385 aa  97.1  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  31.34 
 
 		 1316 aa  96.3  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0153  pectate lyase/Amb allergen  29.06 
 
 		 449 aa  96.3  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2763  Pectate lyase/Amb allergen  25.95 
 
 		 397 aa  95.5  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  29.51 
 
 		 991 aa  94.4  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  30.38 
 
 		 769 aa  94.4  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2168  pectate lyase  29.8 
 
 		 512 aa  94  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.108445  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5013  Pectate lyase/Amb allergen  34.78 
 
 		 427 aa  93.6  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2941  Pectate lyase/Amb allergen  30.82 
 
 		 501 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3434  Pectate lyase/Amb allergen  31.9 
 
 		 504 aa  90.5  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3958  Pectate lyase/Amb allergen  29.17 
 
 		 365 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1091  Pectate lyase/Amb allergen  31.35 
 
 		 392 aa  87.4  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6139  Pectate lyase  27.5 
 
 		 380 aa  87.4  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2764  Pectate lyase/Amb allergen  26.19 
 
 		 402 aa  87.4  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429805  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2566  Pectate lyase/Amb allergen  28.46 
 
 		 368 aa  87  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1231  Pectate lyase/Amb allergen  30.47 
 
 		 919 aa  86.7  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218309  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07646  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVN4]  31.99 
 
 		 327 aa  86.7  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3448  Pectate lyase-like  29.65 
 
 		 594 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372442  hitchhiker  0.00149155 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0132  Pectate lyase/Amb allergen  29.26 
 
 		 505 aa  84  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1087  pectate lyase/Amb allergen  33.7 
 
 		 436 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0821757  hitchhiker  0.00617992 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3821  Pectate lyase/Amb allergen  26.94 
 
 		 456 aa  83.6  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  28.67 
 
 		 922 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  31.55 
 
 		 1409 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  31.25 
 
 		 474 aa  77  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00741  Pectate lyase Precursor (EC 4.2.2.2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00645]  30.22 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  31.15 
 
 		 730 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  28.57 
 
 		 794 aa  74.7  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0495  Pectate lyase/Amb allergen  31.84 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.016328 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2863  Pectate lyase/Amb allergen  29.06 
 
 		 522 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.707547  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0270  Pectate lyase/Amb allergen  26.8 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0352  Pectate lyase/Amb allergen  28.57 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3858  Pectate lyase/Amb allergen  27.92 
 
 		 374 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0271  Pectate lyase/Amb allergen  26.71 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4035  Pectate lyase/Amb allergen  27.04 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1371  Pectate lyase/Amb allergen  28.17 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00120054  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1777  Pectate lyase/Amb allergen  26.24 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0353  Pectate lyase/Amb allergen  25.14 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3839  type III helper protein HopAK1  27.78 
 
 		 543 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02650  pectate lyase  27.06 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1178  Pectate lyase/Amb allergen  24.19 
 
 		 498 aa  63.2  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000219225 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3378  Pectate lyase/Amb allergen  25.96 
 
 		 314 aa  62.4  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4036  Pectate lyase/Amb allergen  29.41 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4037  Pectate lyase/Amb allergen  28.9 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4101  type III helper protein HopAK1  27.86 
 
 		 555 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3859  Pectate lyase/Amb allergen  29.41 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4283  pectin lyase  27.93 
 
 		 414 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3985  Pectate lyase/Amb allergen  25.72 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3860  Pectate lyase/Amb allergen  28.09 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09439  pectin lyase (Eurofung)  25.26 
 
 		 377 aa  53.5  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4281  pectate lyase  24.49 
 
 		 454 aa  47.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02569  Pectin lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA61]  26.67 
 
 		 379 aa  46.6  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7394  Pectate lyase/Amb allergen  22.91 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0906839  normal  0.447007 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3881  Pectate lyase-like  28.82 
 
 		 747 aa  43.5  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000360789  normal  0.117799 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02331  Pectin lyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU6]  27.2 
 
 		 392 aa  43.5  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.37768  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04882  pectin lyase (Eurofung)  24.4 
 
 		 464 aa  43.5  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.485233 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0280  AAA ATPase family protein  36.26 
 
 		 272 aa  43.1  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.582677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>