25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7394 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7394  Pectate lyase/Amb allergen  100 
 
 		 398 aa  823    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0906839  normal  0.447007 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0153  pectate lyase/Amb allergen  29.63 
 
 		 449 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1087  pectate lyase/Amb allergen  27.69 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0821757  hitchhiker  0.00617992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2566  Pectate lyase/Amb allergen  25.85 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1493  pectate lyase  25.79 
 
 		 435 aa  60.1  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0511  Pectate lyase/Amb allergen  22.45 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000797817  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  23.81 
 
 		 991 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2436  Pectate lyase/Amb allergen  26.39 
 
 		 327 aa  54.3  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00169439  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  22.9 
 
 		 554 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5013  Pectate lyase/Amb allergen  25.31 
 
 		 427 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  28.48 
 
 		 769 aa  50.4  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  24.31 
 
 		 482 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1848  Pectate lyase/Amb allergen  23.37 
 
 		 317 aa  50.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2763  Pectate lyase/Amb allergen  26.42 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2863  Pectate lyase/Amb allergen  23.47 
 
 		 522 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.707547  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3434  Pectate lyase/Amb allergen  27.59 
 
 		 504 aa  49.3  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3448  Pectate lyase-like  29.57 
 
 		 594 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372442  hitchhiker  0.00149155 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  26.52 
 
 		 730 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  24.04 
 
 		 486 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3821  Pectate lyase/Amb allergen  27.13 
 
 		 456 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0280  AAA ATPase family protein  40.26 
 
 		 272 aa  47  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.582677  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0430  Pectate lyase/Amb allergen  23.12 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202776  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  27.22 
 
 		 1316 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1089  Pectate lyase/Amb allergen  26.1 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0435  Pectate lyase/Amb allergen  22.91 
 
 		 375 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.017738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>