71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1089 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1089  Pectate lyase/Amb allergen  100 
 
 		 385 aa  782    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1090  Pectate lyase/Amb allergen  72.14 
 
 		 405 aa  569  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2764  Pectate lyase/Amb allergen  71.99 
 
 		 402 aa  557  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429805  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2763  Pectate lyase/Amb allergen  65.8 
 
 		 397 aa  504  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1091  Pectate lyase/Amb allergen  58.91 
 
 		 392 aa  437  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6139  Pectate lyase  42.51 
 
 		 380 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02650  pectate lyase  42.21 
 
 		 346 aa  251  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1178  Pectate lyase/Amb allergen  36.18 
 
 		 498 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000219225 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2863  Pectate lyase/Amb allergen  40.3 
 
 		 522 aa  199  9e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.707547  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3821  Pectate lyase/Amb allergen  35.51 
 
 		 456 aa  198  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0495  Pectate lyase/Amb allergen  41.6 
 
 		 427 aa  190  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.016328 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0153  pectate lyase/Amb allergen  33.16 
 
 		 449 aa  189  7e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5013  Pectate lyase/Amb allergen  42.01 
 
 		 427 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0132  Pectate lyase/Amb allergen  30.17 
 
 		 505 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1493  pectate lyase  34.71 
 
 		 435 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  36.04 
 
 		 730 aa  163  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1087  pectate lyase/Amb allergen  31.94 
 
 		 436 aa  160  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0821757  hitchhiker  0.00617992 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3434  Pectate lyase/Amb allergen  31.42 
 
 		 504 aa  150  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1848  Pectate lyase/Amb allergen  36.42 
 
 		 317 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  40.68 
 
 		 482 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07646  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVN4]  38.25 
 
 		 327 aa  133  5e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2436  Pectate lyase/Amb allergen  39.51 
 
 		 327 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00169439  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  34.97 
 
 		 554 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0430  Pectate lyase/Amb allergen  34.92 
 
 		 335 aa  119  9e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202776  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  37.5 
 
 		 486 aa  117  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0511  Pectate lyase/Amb allergen  30.09 
 
 		 365 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000797817  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  33.66 
 
 		 991 aa  113  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2566  Pectate lyase/Amb allergen  33.56 
 
 		 368 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  33.33 
 
 		 462 aa  106  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0270  Pectate lyase/Amb allergen  30.73 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00741  Pectate lyase Precursor (EC 4.2.2.2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00645]  35.8 
 
 		 326 aa  97.8  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0435  Pectate lyase/Amb allergen  29.79 
 
 		 375 aa  97.1  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.017738  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0352  Pectate lyase/Amb allergen  32.98 
 
 		 375 aa  96.7  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2168  pectate lyase  31.82 
 
 		 512 aa  96.7  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.108445  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0353  Pectate lyase/Amb allergen  33.33 
 
 		 376 aa  96.7  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  31.36 
 
 		 1316 aa  94  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3448  Pectate lyase-like  31.71 
 
 		 594 aa  92.8  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372442  hitchhiker  0.00149155 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3958  Pectate lyase/Amb allergen  30.18 
 
 		 365 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  34.66 
 
 		 922 aa  87.4  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0537  Pectate lyase/Amb allergen  26.78 
 
 		 351 aa  87  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3858  Pectate lyase/Amb allergen  32.4 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4035  Pectate lyase/Amb allergen  32.64 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  30.04 
 
 		 769 aa  84.7  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4037  Pectate lyase/Amb allergen  31.1 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3860  Pectate lyase/Amb allergen  31.1 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  27.5 
 
 		 1409 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1231  Pectate lyase/Amb allergen  31.56 
 
 		 919 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218309  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3859  Pectate lyase/Amb allergen  31.01 
 
 		 374 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  30.5 
 
 		 527 aa  80.9  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2941  Pectate lyase/Amb allergen  32.54 
 
 		 501 aa  80.1  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4036  Pectate lyase/Amb allergen  31.93 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0280  AAA ATPase family protein  42.31 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.582677  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  32.06 
 
 		 794 aa  77  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  31.1 
 
 		 474 aa  73.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0271  Pectate lyase/Amb allergen  30.43 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1371  Pectate lyase/Amb allergen  28.01 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00120054  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1777  Pectate lyase/Amb allergen  29.08 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3378  Pectate lyase/Amb allergen  27.62 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  25.69 
 
 		 686 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02569  Pectin lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA61]  25 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3306  Pectate lyase/Amb allergen  25.23 
 
 		 305 aa  55.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0281  hypothetical protein  30.57 
 
 		 143 aa  53.9  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.342666  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04882  pectin lyase (Eurofung)  27.18 
 
 		 464 aa  53.1  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.485233 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09439  pectin lyase (Eurofung)  24.83 
 
 		 377 aa  50.8  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3985  Pectate lyase/Amb allergen  28.26 
 
 		 421 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971043  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4101  type III helper protein HopAK1  25.86 
 
 		 555 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02331  Pectin lyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU6]  27.23 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.37768  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4283  pectin lyase  28.26 
 
 		 414 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3881  Pectate lyase-like  28.35 
 
 		 747 aa  47  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000360789  normal  0.117799 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3839  type III helper protein HopAK1  25.36 
 
 		 543 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7394  Pectate lyase/Amb allergen  26.1 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0906839  normal  0.447007 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>