59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3434 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3434  Pectate lyase/Amb allergen  100 
 
 		 504 aa  1032    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0132  Pectate lyase/Amb allergen  33.98 
 
 		 505 aa  258  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0153  pectate lyase/Amb allergen  39.23 
 
 		 449 aa  231  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1493  pectate lyase  43.53 
 
 		 435 aa  220  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1087  pectate lyase/Amb allergen  39.46 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0821757  hitchhiker  0.00617992 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3821  Pectate lyase/Amb allergen  36.81 
 
 		 456 aa  201  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  38.96 
 
 		 730 aa  197  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5013  Pectate lyase/Amb allergen  35.05 
 
 		 427 aa  195  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2863  Pectate lyase/Amb allergen  29.23 
 
 		 522 aa  190  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.707547  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1178  Pectate lyase/Amb allergen  31.13 
 
 		 498 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000219225 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6139  Pectate lyase  29.13 
 
 		 380 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2763  Pectate lyase/Amb allergen  32.92 
 
 		 397 aa  161  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1090  Pectate lyase/Amb allergen  27.82 
 
 		 405 aa  160  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2764  Pectate lyase/Amb allergen  31.33 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429805  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1091  Pectate lyase/Amb allergen  29.41 
 
 		 392 aa  158  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0495  Pectate lyase/Amb allergen  31.92 
 
 		 427 aa  157  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.016328 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1089  Pectate lyase/Amb allergen  31.42 
 
 		 385 aa  150  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02650  pectate lyase  29.19 
 
 		 346 aa  150  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0511  Pectate lyase/Amb allergen  29.22 
 
 		 365 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000797817  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0435  Pectate lyase/Amb allergen  31.9 
 
 		 375 aa  90.9  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.017738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  32.98 
 
 		 482 aa  90.5  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1848  Pectate lyase/Amb allergen  30.73 
 
 		 317 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2436  Pectate lyase/Amb allergen  31.71 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00169439  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07646  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVN4]  30.1 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3448  Pectate lyase-like  25.29 
 
 		 594 aa  80.9  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372442  hitchhiker  0.00149155 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0280  AAA ATPase family protein  25.1 
 
 		 272 aa  79  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.582677  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  30 
 
 		 462 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0430  Pectate lyase/Amb allergen  27.69 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202776  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  34.35 
 
 		 922 aa  70.5  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00741  Pectate lyase Precursor (EC 4.2.2.2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00645]  27.81 
 
 		 326 aa  68.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  27.23 
 
 		 527 aa  67.8  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  25.97 
 
 		 686 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  26.77 
 
 		 794 aa  66.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  26.77 
 
 		 474 aa  63.9  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0537  Pectate lyase/Amb allergen  27.69 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  24.9 
 
 		 486 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  25.7 
 
 		 769 aa  61.2  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  33.02 
 
 		 1316 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2168  pectate lyase  26.48 
 
 		 512 aa  57.4  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.108445  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1231  Pectate lyase/Amb allergen  34.06 
 
 		 919 aa  57.4  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218309  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2941  Pectate lyase/Amb allergen  27.27 
 
 		 501 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3958  Pectate lyase/Amb allergen  25.91 
 
 		 365 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  29.11 
 
 		 1409 aa  55.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0352  Pectate lyase/Amb allergen  26.32 
 
 		 375 aa  54.3  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1777  Pectate lyase/Amb allergen  23.71 
 
 		 314 aa  53.5  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  25.56 
 
 		 991 aa  53.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0271  Pectate lyase/Amb allergen  26.92 
 
 		 375 aa  53.5  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2566  Pectate lyase/Amb allergen  25.56 
 
 		 368 aa  52.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0353  Pectate lyase/Amb allergen  26.84 
 
 		 376 aa  52  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1371  Pectate lyase/Amb allergen  23.14 
 
 		 314 aa  50.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00120054  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7394  Pectate lyase/Amb allergen  27.45 
 
 		 398 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0906839  normal  0.447007 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4036  Pectate lyase/Amb allergen  26.54 
 
 		 374 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3378  Pectate lyase/Amb allergen  26.29 
 
 		 314 aa  48.5  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3858  Pectate lyase/Amb allergen  24.74 
 
 		 374 aa  47.4  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0270  Pectate lyase/Amb allergen  25.64 
 
 		 375 aa  47  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3860  Pectate lyase/Amb allergen  25.26 
 
 		 374 aa  46.2  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3859  Pectate lyase/Amb allergen  25.31 
 
 		 374 aa  46.6  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4035  Pectate lyase/Amb allergen  24.21 
 
 		 374 aa  46.6  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4037  Pectate lyase/Amb allergen  25.26 
 
 		 374 aa  46.2  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>