66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1493 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1493  pectate lyase  100 
 
 		 435 aa  878    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1087  pectate lyase/Amb allergen  71.39 
 
 		 436 aa  524  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0821757  hitchhiker  0.00617992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  57.42 
 
 		 730 aa  405  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0153  pectate lyase/Amb allergen  47.54 
 
 		 449 aa  404  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5013  Pectate lyase/Amb allergen  50.34 
 
 		 427 aa  393  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3821  Pectate lyase/Amb allergen  47.9 
 
 		 456 aa  355  6.999999999999999e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0495  Pectate lyase/Amb allergen  46.31 
 
 		 427 aa  341  1e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.016328 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0132  Pectate lyase/Amb allergen  36.61 
 
 		 505 aa  267  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3434  Pectate lyase/Amb allergen  42.28 
 
 		 504 aa  236  6e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1178  Pectate lyase/Amb allergen  38.14 
 
 		 498 aa  218  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000219225 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2863  Pectate lyase/Amb allergen  33.33 
 
 		 522 aa  213  7e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.707547  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6139  Pectate lyase  37.17 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02650  pectate lyase  35.38 
 
 		 346 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2764  Pectate lyase/Amb allergen  36.6 
 
 		 402 aa  187  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429805  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2763  Pectate lyase/Amb allergen  31.68 
 
 		 397 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1090  Pectate lyase/Amb allergen  35.65 
 
 		 405 aa  176  8e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1089  Pectate lyase/Amb allergen  34.26 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1091  Pectate lyase/Amb allergen  33.72 
 
 		 392 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  40 
 
 		 482 aa  139  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1848  Pectate lyase/Amb allergen  39.01 
 
 		 317 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0511  Pectate lyase/Amb allergen  36.67 
 
 		 365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000797817  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2436  Pectate lyase/Amb allergen  36.68 
 
 		 327 aa  117  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00169439  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  35.81 
 
 		 486 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0430  Pectate lyase/Amb allergen  33.5 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202776  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0435  Pectate lyase/Amb allergen  26.98 
 
 		 375 aa  106  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.017738  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0537  Pectate lyase/Amb allergen  34.06 
 
 		 351 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3448  Pectate lyase-like  28.03 
 
 		 594 aa  101  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372442  hitchhiker  0.00149155 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  31.67 
 
 		 462 aa  100  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  28.03 
 
 		 527 aa  98.2  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  25.8 
 
 		 991 aa  95.5  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07646  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVN4]  29.11 
 
 		 327 aa  92.4  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  28.73 
 
 		 554 aa  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  30.48 
 
 		 1409 aa  87  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  31.14 
 
 		 922 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  26.55 
 
 		 686 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00741  Pectate lyase Precursor (EC 4.2.2.2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00645]  32.32 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1231  Pectate lyase/Amb allergen  30.13 
 
 		 919 aa  81.3  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218309  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2566  Pectate lyase/Amb allergen  25.7 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  30.54 
 
 		 794 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0271  Pectate lyase/Amb allergen  28.42 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3958  Pectate lyase/Amb allergen  26.57 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  30.54 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  26.83 
 
 		 769 aa  73.9  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  26.23 
 
 		 1316 aa  72.4  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0353  Pectate lyase/Amb allergen  28.39 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2168  pectate lyase  26.79 
 
 		 512 aa  71.2  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.108445  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2941  Pectate lyase/Amb allergen  27.75 
 
 		 501 aa  71.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0280  AAA ATPase family protein  27.5 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.582677  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4035  Pectate lyase/Amb allergen  29.5 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3858  Pectate lyase/Amb allergen  29.56 
 
 		 374 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0281  hypothetical protein  38.46 
 
 		 143 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.342666  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3859  Pectate lyase/Amb allergen  27.78 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4036  Pectate lyase/Amb allergen  28.63 
 
 		 374 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0270  Pectate lyase/Amb allergen  29.44 
 
 		 375 aa  65.5  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0352  Pectate lyase/Amb allergen  27.8 
 
 		 375 aa  63.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4037  Pectate lyase/Amb allergen  26.95 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7394  Pectate lyase/Amb allergen  25.79 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0906839  normal  0.447007 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3860  Pectate lyase/Amb allergen  27.3 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1371  Pectate lyase/Amb allergen  26.48 
 
 		 314 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00120054  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3378  Pectate lyase/Amb allergen  25.93 
 
 		 314 aa  56.2  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1777  Pectate lyase/Amb allergen  26.36 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3881  Pectate lyase-like  28.06 
 
 		 747 aa  54.3  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000360789  normal  0.117799 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3985  Pectate lyase/Amb allergen  30.49 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971043  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4283  pectin lyase  34.92 
 
 		 414 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04882  pectin lyase (Eurofung)  28.57 
 
 		 464 aa  47.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.485233 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3306  Pectate lyase/Amb allergen  24.52 
 
 		 305 aa  44.3  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>