220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2179 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  100 
 
 		 922 aa  1892    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  57.68 
 
 		 462 aa  499  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  34.68 
 
 		 1409 aa  383  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1008  Pectate disaccharide-lyase  39.11 
 
 		 540 aa  292  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1855  Pectate disaccharide-lyase  50.17 
 
 		 653 aa  281  3e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  53.09 
 
 		 750 aa  278  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  49.11 
 
 		 527 aa  273  1e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1888  hypothetical protein  52.43 
 
 		 616 aa  271  4e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  50.97 
 
 		 576 aa  256  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  33.72 
 
 		 554 aa  235  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3448  Pectate lyase-like  35.16 
 
 		 594 aa  196  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372442  hitchhiker  0.00149155 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  36 
 
 		 1316 aa  191  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  35.75 
 
 		 769 aa  187  8e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3869  fibronectin type III domain-containing protein  41.89 
 
 		 1431 aa  185  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.849627  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2168  pectate lyase  33.09 
 
 		 512 aa  181  5.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.108445  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26480  hypothetical protein  35.31 
 
 		 907 aa  172  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.178741  normal  0.268207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3958  Pectate lyase/Amb allergen  34.04 
 
 		 365 aa  168  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2941  Pectate lyase/Amb allergen  32.06 
 
 		 501 aa  160  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2919  hypothetical protein  38.64 
 
 		 338 aa  159  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000462284  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  38.52 
 
 		 489 aa  157  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0430  Pectate lyase/Amb allergen  39.75 
 
 		 335 aa  154  7e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202776  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07646  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVN4]  39.69 
 
 		 327 aa  152  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4259  exopolygalacturonate lyase  35.88 
 
 		 744 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4134  Pectate disaccharide-lyase  33.66 
 
 		 700 aa  143  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.275523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0353  Pectate lyase/Amb allergen  32.03 
 
 		 376 aa  142  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000914  putative exopolygalacturonate lyase  33.8 
 
 		 742 aa  141  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0511  Pectate lyase/Amb allergen  31.33 
 
 		 365 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000797817  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0352  Pectate lyase/Amb allergen  31.22 
 
 		 375 aa  139  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.85 
 
 		 831 aa  137  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4562  exopolygalacturonate lyase  34.35 
 
 		 744 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3860  Pectate lyase/Amb allergen  31.3 
 
 		 374 aa  132  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3858  Pectate lyase/Amb allergen  31.64 
 
 		 374 aa  132  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4037  Pectate lyase/Amb allergen  31.48 
 
 		 374 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00741  Pectate lyase Precursor (EC 4.2.2.2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00645]  36.12 
 
 		 326 aa  127  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0270  Pectate lyase/Amb allergen  28.54 
 
 		 375 aa  126  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3859  Pectate lyase/Amb allergen  31.15 
 
 		 374 aa  125  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4036  Pectate lyase/Amb allergen  31.37 
 
 		 374 aa  125  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4196  exopolygalacturonate lyase  32.7 
 
 		 734 aa  125  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4035  Pectate lyase/Amb allergen  31.82 
 
 		 374 aa  125  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  35.81 
 
 		 820 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02537  pectate lyase (Eurofung)  33.44 
 
 		 410 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3996  exopolygalacturonate lyase  32.68 
 
 		 734 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  28.7 
 
 		 686 aa  122  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0271  Pectate lyase/Amb allergen  29.95 
 
 		 375 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1528  Parallel beta-helix repeat protein  32.25 
 
 		 425 aa  115  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1848  Pectate lyase/Amb allergen  32.12 
 
 		 317 aa  114  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2946  hypothetical protein  31.63 
 
 		 733 aa  113  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000153655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1887  hypothetical protein  31.5 
 
 		 426 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  29 
 
 		 474 aa  105  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6139  Pectate lyase  26.26 
 
 		 380 aa  104  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  33.13 
 
 		 482 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1089  Pectate lyase/Amb allergen  33.2 
 
 		 385 aa  102  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2436  Pectate lyase/Amb allergen  32.21 
 
 		 327 aa  101  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00169439  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  28.67 
 
 		 794 aa  100  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1231  Pectate lyase/Amb allergen  31.14 
 
 		 919 aa  100  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218309  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3576  hemolysin-type calcium-binding region  32.38 
 
 		 547 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0435  Pectate lyase/Amb allergen  28.67 
 
 		 375 aa  97.4  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.017738  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0852  pectate lyase  29.25 
 
 		 415 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  57.65 
 
 		 591 aa  94.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  28.57 
 
 		 991 aa  92.8  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2566  Pectate lyase/Amb allergen  29.41 
 
 		 368 aa  93.6  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1090  Pectate lyase/Amb allergen  28.72 
 
 		 405 aa  92.8  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  65.71 
 
 		 630 aa  92.8  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2863  Pectate lyase/Amb allergen  32.56 
 
 		 522 aa  91.3  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.707547  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2764  Pectate lyase/Amb allergen  28.18 
 
 		 402 aa  91.3  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429805  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5013  Pectate lyase/Amb allergen  29.41 
 
 		 427 aa  91.3  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2763  Pectate lyase/Amb allergen  28.67 
 
 		 397 aa  90.5  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0153  pectate lyase/Amb allergen  32.02 
 
 		 449 aa  89.7  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2204  pectate lyase  30.25 
 
 		 439 aa  89  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.748809  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  62.12 
 
 		 567 aa  88.6  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3056  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.39 
 
 		 694 aa  88.2  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  29.23 
 
 		 486 aa  87.4  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2305  pectate lyase  27.07 
 
 		 439 aa  86.7  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.708632  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2045  pectate lyase  28.86 
 
 		 437 aa  86.3  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  49.02 
 
 		 736 aa  85.9  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0537  Pectate lyase/Amb allergen  23.81 
 
 		 351 aa  86.3  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  62.86 
 
 		 477 aa  85.1  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1773  pectate lyase  28.52 
 
 		 437 aa  84  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  42.22 
 
 		 563 aa  84  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  30.62 
 
 		 730 aa  83.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  56.76 
 
 		 649 aa  83.2  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1493  pectate lyase  31.14 
 
 		 435 aa  83.2  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  48.28 
 
 		 710 aa  82  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  52.5 
 
 		 895 aa  81.3  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  60.61 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02650  pectate lyase  25.8 
 
 		 346 aa  80.9  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  46.6 
 
 		 710 aa  80.5  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  45.1 
 
 		 611 aa  80.5  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1087  pectate lyase/Amb allergen  30.58 
 
 		 436 aa  80.1  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0821757  hitchhiker  0.00617992 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  49.32 
 
 		 948 aa  80.1  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0495  Pectate lyase/Amb allergen  30 
 
 		 427 aa  79.7  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.016328 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  59.09 
 
 		 639 aa  79.3  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  53.42 
 
 		 900 aa  79  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  57.81 
 
 		 928 aa  79  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  59.38 
 
 		 789 aa  78.6  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  43.62 
 
 		 739 aa  78.2  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  51.72 
 
 		 582 aa  77.8  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  44.23 
 
 		 683 aa  77.4  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  44.44 
 
 		 1077 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3821  Pectate lyase/Amb allergen  26.51 
 
 		 456 aa  76.6  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>