70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1008 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1008  Pectate disaccharide-lyase  100 
 
 		 540 aa  1082    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  74.93 
 
 		 576 aa  557  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  53.94 
 
 		 750 aa  351  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1855  Pectate disaccharide-lyase  50.45 
 
 		 653 aa  318  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  39.58 
 
 		 922 aa  294  3e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1888  hypothetical protein  49.83 
 
 		 616 aa  276  9e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  43.79 
 
 		 1409 aa  251  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3869  fibronectin type III domain-containing protein  42.96 
 
 		 1431 aa  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.849627  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26480  hypothetical protein  42.32 
 
 		 907 aa  211  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.178741  normal  0.268207 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4259  exopolygalacturonate lyase  36.75 
 
 		 744 aa  194  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4562  exopolygalacturonate lyase  36.75 
 
 		 744 aa  194  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  41.94 
 
 		 489 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4196  exopolygalacturonate lyase  36.78 
 
 		 734 aa  189  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000914  putative exopolygalacturonate lyase  38.49 
 
 		 742 aa  188  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3996  exopolygalacturonate lyase  35.24 
 
 		 734 aa  183  7e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4134  Pectate disaccharide-lyase  35.22 
 
 		 700 aa  165  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.275523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2919  hypothetical protein  34.56 
 
 		 338 aa  156  9e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000462284  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02537  pectate lyase (Eurofung)  36.23 
 
 		 410 aa  147  4.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1887  hypothetical protein  36.13 
 
 		 426 aa  144  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1528  Parallel beta-helix repeat protein  34.5 
 
 		 425 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2946  hypothetical protein  32.54 
 
 		 733 aa  131  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000153655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0852  pectate lyase  32.86 
 
 		 415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2305  pectate lyase  33.44 
 
 		 439 aa  127  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.708632  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3576  hemolysin-type calcium-binding region  34.28 
 
 		 547 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1773  pectate lyase  31.46 
 
 		 437 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  48.8 
 
 		 649 aa  116  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2045  pectate lyase  31.15 
 
 		 437 aa  114  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2204  pectate lyase  32.12 
 
 		 439 aa  113  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.748809  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  48.12 
 
 		 809 aa  113  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  41.09 
 
 		 769 aa  98.6  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8075  Carbohydrate binding family 6  41.8 
 
 		 401 aa  98.6  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  41.73 
 
 		 1316 aa  96.7  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  43.75 
 
 		 554 aa  95.9  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3056  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.6 
 
 		 694 aa  95.1  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  42.15 
 
 		 511 aa  94  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  39.84 
 
 		 831 aa  89.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1931  Pectate lyase  29.63 
 
 		 458 aa  86.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.24321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  36.92 
 
 		 820 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3575  pectate lyase L precursor  29.43 
 
 		 491 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2655  Carbohydrate binding family 6  40.16 
 
 		 847 aa  81.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  39.02 
 
 		 789 aa  80.1  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2947  hypothetical protein  41.6 
 
 		 574 aa  78.2  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00368039  normal  0.813372 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3881  Pectate lyase-like  32.59 
 
 		 747 aa  76.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000360789  normal  0.117799 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1051  Serine O-acetyltransferase  38.02 
 
 		 700 aa  76.6  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  33.96 
 
 		 1000 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  35.9 
 
 		 772 aa  75.5  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  29.11 
 
 		 1091 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  33.87 
 
 		 2073 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6865  glycoside hydrolase family 31  36.51 
 
 		 1016 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6906  glycoside hydrolase family 16  35.07 
 
 		 628 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00349487  hitchhiker  0.000227833 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1650  pseudouridine synthase, Rsu  34.26 
 
 		 914 aa  64.3  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  31.5 
 
 		 1207 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4535  carbohydrate-binding family 6 protein  29.81 
 
 		 898 aa  57.4  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.334196  normal  0.875686 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  32.14 
 
 		 790 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  37.9 
 
 		 938 aa  53.9  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  29.08 
 
 		 456 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  34.83 
 
 		 877 aa  51.2  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4296  carbohydrate-binding family 6 protein  33.72 
 
 		 767 aa  50.4  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  38.75 
 
 		 965 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04681  putative secreted protein  30.1 
 
 		 700 aa  48.5  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  32.22 
 
 		 1167 aa  48.5  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  29.82 
 
 		 1128 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3331  carbohydrate-binding family 6 protein  30.1 
 
 		 747 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  30.5 
 
 		 612 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6504  glycoside hydrolase family 18  29.71 
 
 		 580 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462594  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0099  hypothetical protein  34.88 
 
 		 520 aa  45.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0662  parallel beta-helix repeat-containing protein  36 
 
 		 500 aa  44.3  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000522571  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2259  Carbohydrate binding family 6  37.84 
 
 		 713 aa  43.9  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1237  hypothetical protein  38.55 
 
 		 689 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.157954 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0371  hypothetical protein  26.55 
 
 		 480 aa  43.5  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>