30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4196 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4562  exopolygalacturonate lyase  74.76 
 
 		 744 aa  1137    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4134  Pectate disaccharide-lyase  61.86 
 
 		 700 aa  875    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.275523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4259  exopolygalacturonate lyase  74.62 
 
 		 744 aa  1132    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4196  exopolygalacturonate lyase  100 
 
 		 734 aa  1509    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3996  exopolygalacturonate lyase  80.38 
 
 		 734 aa  1233    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000914  putative exopolygalacturonate lyase  46.13 
 
 		 742 aa  619  1e-176  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  36.53 
 
 		 750 aa  211  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26480  hypothetical protein  27.69 
 
 		 907 aa  203  9e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.178741  normal  0.268207 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3869  fibronectin type III domain-containing protein  30.93 
 
 		 1431 aa  196  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.849627  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  38.6 
 
 		 576 aa  191  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1008  Pectate disaccharide-lyase  36.78 
 
 		 540 aa  190  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1855  Pectate disaccharide-lyase  32.98 
 
 		 653 aa  173  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1888  hypothetical protein  30.1 
 
 		 616 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  35.69 
 
 		 1409 aa  162  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  32.7 
 
 		 922 aa  125  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1887  hypothetical protein  30.69 
 
 		 426 aa  123  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02537  pectate lyase (Eurofung)  30.41 
 
 		 410 aa  120  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1528  Parallel beta-helix repeat protein  36.44 
 
 		 425 aa  120  9e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2919  hypothetical protein  29.55 
 
 		 338 aa  114  9e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000462284  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  32.99 
 
 		 489 aa  112  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2946  hypothetical protein  30.46 
 
 		 733 aa  111  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000153655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2045  pectate lyase  28.65 
 
 		 437 aa  97.8  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1773  pectate lyase  30.18 
 
 		 437 aa  96.7  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0852  pectate lyase  30.77 
 
 		 415 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2305  pectate lyase  26.55 
 
 		 439 aa  91.7  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.708632  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3576  hemolysin-type calcium-binding region  31.45 
 
 		 547 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1931  Pectate lyase  27.52 
 
 		 458 aa  89.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.24321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2204  pectate lyase  32.51 
 
 		 439 aa  80.1  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.748809  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3056  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.5 
 
 		 694 aa  77.4  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3575  pectate lyase L precursor  25 
 
 		 491 aa  57.8  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>