36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3869 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3869  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 		 1431 aa  2898    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.849627  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26480  hypothetical protein  33 
 
 		 907 aa  360  9.999999999999999e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.178741  normal  0.268207 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  89.89 
 
 		 2457 aa  342  4e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  31.88 
 
 		 1409 aa  299  3e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1855  Pectate disaccharide-lyase  39.66 
 
 		 653 aa  232  5e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1888  hypothetical protein  38.59 
 
 		 616 aa  229  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  37.34 
 
 		 750 aa  228  8e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  44.32 
 
 		 576 aa  216  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1008  Pectate disaccharide-lyase  42.96 
 
 		 540 aa  215  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000914  putative exopolygalacturonate lyase  29.06 
 
 		 742 aa  208  6e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4134  Pectate disaccharide-lyase  32.27 
 
 		 700 aa  197  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.275523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3996  exopolygalacturonate lyase  32.29 
 
 		 734 aa  197  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4562  exopolygalacturonate lyase  31.52 
 
 		 744 aa  196  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4196  exopolygalacturonate lyase  30.93 
 
 		 734 aa  196  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4259  exopolygalacturonate lyase  27.59 
 
 		 744 aa  194  8e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  41.89 
 
 		 922 aa  186  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1528  Parallel beta-helix repeat protein  37.18 
 
 		 425 aa  138  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1887  hypothetical protein  37.31 
 
 		 426 aa  136  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  35.35 
 
 		 489 aa  133  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2946  hypothetical protein  36.42 
 
 		 733 aa  123  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000153655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2045  pectate lyase  32.59 
 
 		 437 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2919  hypothetical protein  37.27 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000462284  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1773  pectate lyase  32.59 
 
 		 437 aa  114  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0852  pectate lyase  33.33 
 
 		 415 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2305  pectate lyase  32.31 
 
 		 439 aa  112  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.708632  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3576  hemolysin-type calcium-binding region  32.79 
 
 		 547 aa  108  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02537  pectate lyase (Eurofung)  30.85 
 
 		 410 aa  105  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1931  Pectate lyase  30.23 
 
 		 458 aa  92.8  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.24321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3056  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.43 
 
 		 694 aa  89.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2204  pectate lyase  30.03 
 
 		 439 aa  85.1  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.748809  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3575  pectate lyase L precursor  27.25 
 
 		 491 aa  79.7  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1063  hypothetical protein  32.95 
 
 		 1263 aa  70.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0107018  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0063  peptidoglycan-binding LysM  52.38 
 
 		 202 aa  46.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0180593  normal  0.117773 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  25.62 
 
 		 665 aa  45.8  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0099  hypothetical protein  40.3 
 
 		 520 aa  46.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  33.71 
 
 		 1281 aa  45.8  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>