61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2919 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2919  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  682    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000462284  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1888  hypothetical protein  43.79 
 
 		 616 aa  211  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1855  Pectate disaccharide-lyase  40.72 
 
 		 653 aa  204  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  39.49 
 
 		 489 aa  199  6e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1887  hypothetical protein  39.61 
 
 		 426 aa  182  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1528  Parallel beta-helix repeat protein  38.03 
 
 		 425 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2946  hypothetical protein  40.65 
 
 		 733 aa  179  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000153655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  38.04 
 
 		 1409 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  38.46 
 
 		 750 aa  172  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  36.97 
 
 		 576 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  38.64 
 
 		 922 aa  159  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1008  Pectate disaccharide-lyase  34.35 
 
 		 540 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0852  pectate lyase  31.71 
 
 		 415 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2305  pectate lyase  31.56 
 
 		 439 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.708632  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1773  pectate lyase  32.24 
 
 		 437 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2204  pectate lyase  31.79 
 
 		 439 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.748809  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2045  pectate lyase  29.54 
 
 		 437 aa  123  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1931  Pectate lyase  29.82 
 
 		 458 aa  123  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.24321  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02537  pectate lyase (Eurofung)  30.66 
 
 		 410 aa  122  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4259  exopolygalacturonate lyase  30.65 
 
 		 744 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4196  exopolygalacturonate lyase  29.66 
 
 		 734 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3869  fibronectin type III domain-containing protein  37.27 
 
 		 1431 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.849627  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3996  exopolygalacturonate lyase  30.34 
 
 		 734 aa  112  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4562  exopolygalacturonate lyase  30.93 
 
 		 744 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4134  Pectate disaccharide-lyase  30.8 
 
 		 700 aa  106  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.275523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26480  hypothetical protein  30.58 
 
 		 907 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.178741  normal  0.268207 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000914  putative exopolygalacturonate lyase  30.17 
 
 		 742 aa  96.7  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3576  hemolysin-type calcium-binding region  31.58 
 
 		 547 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3575  pectate lyase L precursor  28.43 
 
 		 491 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3056  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.24 
 
 		 694 aa  82.8  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.78 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.640976 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0292  parallel beta-helix repeat-containing protein  35.97 
 
 		 463 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4845  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.29 
 
 		 456 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0603533  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0371  hypothetical protein  25.77 
 
 		 480 aa  55.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6876  Hemolysin-type calcium-binding region  30.15 
 
 		 547 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2775  hypothetical protein  34.48 
 
 		 1201 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  26.36 
 
 		 665 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3548  hypothetical protein  24.24 
 
 		 505 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0896627  normal  0.0134633 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0361  hypothetical protein  33.05 
 
 		 341 aa  50.4  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4180  parallel beta-helix repeat protein protein  36.04 
 
 		 513 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23585  normal  0.0401044 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3115  hypothetical protein  32.28 
 
 		 368 aa  50.1  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  31.39 
 
 		 677 aa  49.7  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3111  hypothetical protein  31.06 
 
 		 446 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2960  PKD domain containing protein  35.65 
 
 		 687 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6850  Hemolysin-type calcium-binding region  29.63 
 
 		 565 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2868  PKD domain containing protein  35.4 
 
 		 687 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2575  Parallel beta-helix repeat protein  34.59 
 
 		 495 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1313  hypothetical protein  29.08 
 
 		 451 aa  47  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2350  hypothetical protein  33.06 
 
 		 473 aa  47  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4387  hypothetical protein  26.16 
 
 		 502 aa  46.6  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2257  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  37.18 
 
 		 496 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.719772 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3238  hypothetical protein  24.24 
 
 		 652 aa  46.2  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359216  normal  0.364609 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0662  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.33 
 
 		 500 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000522571  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5086  hypothetical protein  24.85 
 
 		 421 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3227  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  35.9 
 
 		 537 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.751454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2979  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  32.17 
 
 		 541 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  30.5 
 
 		 759 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  46.77 
 
 		 1318 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  30.19 
 
 		 1024 aa  43.1  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2766  hypothetical protein  46.43 
 
 		 1106 aa  42.7  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000116349  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  34.91 
 
 		 965 aa  42.4  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>