106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1855 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1855  Pectate disaccharide-lyase  100 
 
 		 653 aa  1333    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1854  Pectate lyase  100 
 
 		 460 aa  413  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  51.05 
 
 		 750 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1888  hypothetical protein  49.03 
 
 		 616 aa  363  8e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  51.23 
 
 		 576 aa  326  9e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1008  Pectate disaccharide-lyase  50.3 
 
 		 540 aa  325  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  50.75 
 
 		 1409 aa  318  2e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  50.67 
 
 		 922 aa  289  9e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3869  fibronectin type III domain-containing protein  40.15 
 
 		 1431 aa  240  5.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.849627  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26480  hypothetical protein  41.16 
 
 		 907 aa  223  9e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.178741  normal  0.268207 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  39.43 
 
 		 489 aa  211  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2919  hypothetical protein  40.11 
 
 		 338 aa  207  6e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000462284  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4259  exopolygalacturonate lyase  36.39 
 
 		 744 aa  206  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4562  exopolygalacturonate lyase  35.6 
 
 		 744 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3996  exopolygalacturonate lyase  32.98 
 
 		 734 aa  176  9e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4196  exopolygalacturonate lyase  32.72 
 
 		 734 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1887  hypothetical protein  34.68 
 
 		 426 aa  173  7.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000914  putative exopolygalacturonate lyase  35.4 
 
 		 742 aa  170  8e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0852  pectate lyase  32.16 
 
 		 415 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1528  Parallel beta-helix repeat protein  33.81 
 
 		 425 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2946  hypothetical protein  34.73 
 
 		 733 aa  164  6e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000153655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1773  pectate lyase  32.61 
 
 		 437 aa  158  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4134  Pectate disaccharide-lyase  35.49 
 
 		 700 aa  155  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.275523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2045  pectate lyase  32.37 
 
 		 437 aa  151  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02537  pectate lyase (Eurofung)  34.84 
 
 		 410 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3576  hemolysin-type calcium-binding region  33.42 
 
 		 547 aa  146  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2305  pectate lyase  32.61 
 
 		 439 aa  143  8e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.708632  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1931  Pectate lyase  31.61 
 
 		 458 aa  137  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.24321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2204  pectate lyase  31.16 
 
 		 439 aa  137  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.748809  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3056  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.97 
 
 		 694 aa  118  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3575  pectate lyase L precursor  29.16 
 
 		 491 aa  106  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2353  hypothetical protein  39.75 
 
 		 667 aa  91.3  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  31.67 
 
 		 3197 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  29.44 
 
 		 3197 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  50 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3389  Heparinase II/III family protein  26.7 
 
 		 1260 aa  62  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  49.3 
 
 		 916 aa  60.5  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  29 
 
 		 2105 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.51 
 
 		 1655 aa  57  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1839  hypothetical protein  27.14 
 
 		 262 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.358856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  33.03 
 
 		 1281 aa  56.6  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4013  peptidoglycan-binding LysM  50.82 
 
 		 203 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  34.75 
 
 		 951 aa  55.8  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.35 
 
 		 824 aa  54.3  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  37.63 
 
 		 965 aa  53.9  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0371  hypothetical protein  33.61 
 
 		 480 aa  53.5  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0361  hypothetical protein  32.54 
 
 		 341 aa  53.9  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  26.54 
 
 		 665 aa  53.5  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2876  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.11 
 
 		 512 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0063  peptidoglycan-binding LysM  31.87 
 
 		 202 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0180593  normal  0.117773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  42.55 
 
 		 846 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  53.85 
 
 		 671 aa  52.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  43.37 
 
 		 771 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  37.74 
 
 		 2313 aa  51.2  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  26.32 
 
 		 855 aa  51.2  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.74 
 
 		 257 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2499  ADP-ribosylation/Crystallin J1  29.46 
 
 		 703 aa  51.2  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1097  hypothetical protein  27.35 
 
 		 696 aa  50.8  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  42.42 
 
 		 489 aa  50.8  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2504  hypothetical protein  27.37 
 
 		 255 aa  50.8  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  54.84 
 
 		 830 aa  50.4  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2289  peptidase M23B  39.19 
 
 		 457 aa  50.4  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000911471  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1281  hypothetical protein  40.62 
 
 		 430 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.197658 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1516  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.699928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  50 
 
 		 444 aa  49.7  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0528  hypothetical protein  53.19 
 
 		 431 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  41.18 
 
 		 268 aa  49.7  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3987  hypothetical protein  28.93 
 
 		 221 aa  49.3  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1636  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.4 
 
 		 627 aa  49.3  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.41391 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0051  peptidoglycan-binding LysM  50.88 
 
 		 436 aa  48.5  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.492826  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  59.09 
 
 		 329 aa  48.9  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  37.84 
 
 		 1024 aa  48.5  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0151  ATP-dependent DNA helicase RepA  24.59 
 
 		 494 aa  48.1  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.211461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  49.18 
 
 		 914 aa  47.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  44.93 
 
 		 455 aa  47.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2598  hypothetical protein  27.6 
 
 		 225 aa  47.8  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.243823  hitchhiker  0.00133027 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  39.39 
 
 		 667 aa  47.4  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2623  hypothetical protein  25.44 
 
 		 216 aa  46.6  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1237  hypothetical protein  34.18 
 
 		 689 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.157954 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  57.45 
 
 		 1034 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49209  predicted protein  41.18 
 
 		 526 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0370698  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2643  hypothetical protein  41.27 
 
 		 323 aa  47  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1374  hypothetical protein  26.8 
 
 		 1362 aa  46.2  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  59.38 
 
 		 453 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2387  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.61 
 
 		 515 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0495  penicillin-binding protein 2  42.65 
 
 		 775 aa  46.6  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  43.53 
 
 		 840 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  46.97 
 
 		 555 aa  45.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50210  predicted protein  38.95 
 
 		 521 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.722754  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  50.79 
 
 		 625 aa  45.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4120  hypothetical protein  38.89 
 
 		 153 aa  45.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48492  predicted protein  41.79 
 
 		 488 aa  44.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.439098  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2967  protein of unknown function DUF1680  23.03 
 
 		 838 aa  45.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000186086  hitchhiker  0.000639223 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  51.39 
 
 		 778 aa  44.7  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  49.23 
 
 		 1394 aa  44.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4306  FHA domain-containing protein  31.33 
 
 		 4123 aa  44.7  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0160  hypothetical protein  54.76 
 
 		 600 aa  44.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06210  Pol II transcription elongation factor, putative  38.16 
 
 		 1152 aa  44.3  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  50 
 
 		 476 aa  44.3  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  50 
 
 		 458 aa  44.3  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>