83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4621 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  100 
 
 		 830 aa  1621    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0423  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  79.5 
 
 		 824 aa  342  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.657056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  35.45 
 
 		 706 aa  203  8e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1055  hypothetical protein  36.51 
 
 		 666 aa  196  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00001121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0377  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  34.69 
 
 		 404 aa  174  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2403  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  27.4 
 
 		 659 aa  174  6.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000436928  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1530  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  35.68 
 
 		 1537 aa  172  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0686  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  32.98 
 
 		 680 aa  158  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0594  PKD domain-containing protein  33.42 
 
 		 466 aa  157  8e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1865  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  30.11 
 
 		 575 aa  155  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5142  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  32.16 
 
 		 529 aa  147  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0225115  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1775  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  34.88 
 
 		 609 aa  147  9e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910823  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2195  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  31.08 
 
 		 676 aa  146  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.848428  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0892  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  30.6 
 
 		 682 aa  146  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1375  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  34.68 
 
 		 674 aa  146  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0596  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  30.91 
 
 		 680 aa  139  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2122  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  28.64 
 
 		 590 aa  137  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.553057  normal  0.356017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2123  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  30.32 
 
 		 587 aa  137  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.14818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1230  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  29.67 
 
 		 680 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.491664  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5100  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  29.97 
 
 		 548 aa  135  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908648  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5079  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  30.85 
 
 		 693 aa  135  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6754  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  29.36 
 
 		 627 aa  133  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 691 aa  130  8.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1931  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  27.68 
 
 		 684 aa  128  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195615  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6514  hypothetical protein  30.18 
 
 		 651 aa  127  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0261  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  30.24 
 
 		 486 aa  123  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  0.813855 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  45.64 
 
 		 2353 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  47.34 
 
 		 1394 aa  110  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  43.1 
 
 		 2313 aa  105  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5059  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  27.01 
 
 		 406 aa  92.4  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.241627  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3770  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  28.94 
 
 		 595 aa  89  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707249 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  36.94 
 
 		 1000 aa  83.2  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  51.28 
 
 		 916 aa  80.5  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  36.56 
 
 		 671 aa  79  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  43.35 
 
 		 625 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48888  predicted protein  33.46 
 
 		 645 aa  76.6  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2172  quinoprotein (ISS); K06485 integrin alpha 6  28.99 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2823  quinoprotein (ISS)  33.67 
 
 		 444 aa  72.8  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0323  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  28.86 
 
 		 449 aa  71.6  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0274075  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  46.15 
 
 		 453 aa  71.2  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39253  predicted protein  27.1 
 
 		 1538 aa  70.9  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  38.46 
 
 		 605 aa  70.5  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3525  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  28.95 
 
 		 1672 aa  69.7  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2094  hypothetical protein  27.62 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.991915  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0044  PKD domain-containing protein  27.3 
 
 		 396 aa  67  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  50 
 
 		 778 aa  66.2  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8620  hypothetical protein  29.5 
 
 		 458 aa  63.9  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46170  predicted protein  31.17 
 
 		 1069 aa  63.5  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3042  PKD  38.89 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.971034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2404  FHA domain-containing protein  41.13 
 
 		 489 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210357  hitchhiker  0.0000326037 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0791  hypothetical protein  24.52 
 
 		 692 aa  59.3  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.195904  normal  0.0459938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  39.57 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  54.32 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48565  predicted protein  33.64 
 
 		 648 aa  58.5  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.767614  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4699  hypothetical protein  36.26 
 
 		 178 aa  58.2  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  40.87 
 
 		 489 aa  57.8  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5056  hypothetical protein  38.82 
 
 		 143 aa  57  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1333  hypothetical protein  33.33 
 
 		 232 aa  57.4  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48553  predicted protein  30.61 
 
 		 952 aa  56.6  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.102709  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  39.04 
 
 		 1159 aa  56.2  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0483  hypothetical protein  36.57 
 
 		 476 aa  55.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.105295 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  36.24 
 
 		 1567 aa  55.1  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  36 
 
 		 268 aa  54.7  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  26.41 
 
 		 926 aa  53.9  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  34.38 
 
 		 504 aa  53.9  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  48.75 
 
 		 846 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1048  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component  47.83 
 
 		 603 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.110621  unclonable  0.00000000484608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1019  hypothetical protein  47.83 
 
 		 603 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43450  predicted protein  40.2 
 
 		 467 aa  50.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  51.81 
 
 		 356 aa  49.7  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  50 
 
 		 456 aa  48.5  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48494  predicted protein  31.06 
 
 		 582 aa  48.1  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  48.53 
 
 		 914 aa  48.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.67 
 
 		 257 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  35.78 
 
 		 551 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  33.7 
 
 		 1096 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47823  predicted protein  41.43 
 
 		 219 aa  47  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  49.28 
 
 		 667 aa  46.6  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  34.51 
 
 		 455 aa  45.8  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1728  hypothetical protein  37.5 
 
 		 639 aa  45.8  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.633344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43595  predicted protein  40.96 
 
 		 329 aa  45.8  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.796402  normal  0.0151385 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2643  hypothetical protein  45.1 
 
 		 323 aa  45.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47575  predicted protein  43.27 
 
 		 744 aa  45.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.759441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>