49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47575 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_47575  predicted protein  100 
 
 
744 aa  1477    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.759441  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47544  predicted protein  48.72 
 
 
935 aa  83.6  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47562  predicted protein  41.9 
 
 
541 aa  82.8  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  40.1 
 
 
1000 aa  80.1  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47657  predicted protein  36.67 
 
 
583 aa  70.9  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  42.68 
 
 
2313 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  44.23 
 
 
840 aa  68.6  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  38.1 
 
 
830 aa  67.8  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  30.14 
 
 
504 aa  67  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  40.37 
 
 
551 aa  63.9  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49133  predicted protein  34.5 
 
 
590 aa  60.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48565  predicted protein  37.72 
 
 
648 aa  57.8  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.767614  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  33.18 
 
 
453 aa  57.8  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.76 
 
 
261 aa  57.4  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  37.88 
 
 
555 aa  57.4  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43450  predicted protein  41.67 
 
 
467 aa  56.2  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45068  predicted protein  37.07 
 
 
479 aa  55.1  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  39.85 
 
 
1567 aa  54.7  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48494  predicted protein  33.9 
 
 
582 aa  53.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47260  predicted protein  42.03 
 
 
398 aa  53.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.776237  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46405  predicted protein  36.36 
 
 
813 aa  52.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  32.85 
 
 
1461 aa  52.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  40.24 
 
 
625 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48495  predicted protein  36.61 
 
 
472 aa  51.2  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.380882  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2777  hypothetical protein  34.93 
 
 
428 aa  51.2  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51761  predicted protein  40.94 
 
 
136 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.935673  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42501  predicted protein  36.62 
 
 
755 aa  50.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  35.42 
 
 
846 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14322  predicted protein  50.54 
 
 
138 aa  50.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  27.27 
 
 
489 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47701  predicted protein  32.84 
 
 
795 aa  49.3  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  37.86 
 
 
407 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  25.12 
 
 
499 aa  48.9  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45682  predicted protein  37.72 
 
 
633 aa  48.1  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  35.04 
 
 
1096 aa  48.5  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48492  predicted protein  35 
 
 
488 aa  48.1  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.439098  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50357  predicted protein  32.02 
 
 
789 aa  48.1  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  46.77 
 
 
1217 aa  47.8  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44705  predicted protein  38.97 
 
 
735 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43691  predicted protein  34.63 
 
 
354 aa  47.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183589  normal  0.0384489 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47888  predicted protein  28.38 
 
 
854 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.554333  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_8524  predicted protein  47.44 
 
 
65 aa  45.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0570066  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1469  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  48.08 
 
 
445 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854841  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  50.85 
 
 
444 aa  45.8  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33106  predicted protein  33.12 
 
 
657 aa  45.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  36.94 
 
 
489 aa  45.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  34.78 
 
 
458 aa  45.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43595  predicted protein  33.16 
 
 
329 aa  45.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.796402  normal  0.0151385 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47561  predicted protein  29.47 
 
 
521 aa  43.9  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>