43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2403 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2403  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  100 
 
 
659 aa  1320    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000436928  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0686  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  58.13 
 
 
680 aa  511  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5100  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  52.88 
 
 
548 aa  489  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2195  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  44.99 
 
 
676 aa  482  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.848428  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0892  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  53.98 
 
 
682 aa  474  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0596  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  51.6 
 
 
680 aa  451  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056787  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1931  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  42.46 
 
 
684 aa  442  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195615  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1230  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  51.81 
 
 
680 aa  437  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.491664  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5142  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  45.02 
 
 
529 aa  392  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0225115  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1375  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  52.12 
 
 
674 aa  386  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1865  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  43.79 
 
 
575 aa  385  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5079  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  43.59 
 
 
693 aa  328  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.65 
 
 
691 aa  326  9e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2123  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  43.01 
 
 
587 aa  312  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.14818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2122  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  40.17 
 
 
590 aa  310  4e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.553057  normal  0.356017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1775  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  40.65 
 
 
609 aa  273  8.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910823  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1530  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  40 
 
 
1537 aa  261  3e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277699  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5059  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  41.93 
 
 
406 aa  260  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.241627  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  36.19 
 
 
706 aa  236  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1055  hypothetical protein  33.55 
 
 
666 aa  208  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00001121  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6754  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  34.19 
 
 
627 aa  206  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  27.24 
 
 
830 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0594  PKD domain-containing protein  30.46 
 
 
466 aa  166  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0423  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  30.43 
 
 
824 aa  156  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.657056  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0377  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  30.32 
 
 
404 aa  153  8.999999999999999e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1333  hypothetical protein  41.67 
 
 
232 aa  134  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  49.62 
 
 
872 aa  130  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2251  hypothetical protein  45.86 
 
 
887 aa  124  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00410803  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5056  hypothetical protein  69.32 
 
 
143 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0261  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  28.51 
 
 
486 aa  120  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  0.813855 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1205  hypothetical protein  43.51 
 
 
537 aa  118  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000167007  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0646  hypothetical protein  40.46 
 
 
521 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0323  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  26.34 
 
 
449 aa  93.2  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0274075  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2823  quinoprotein (ISS)  29.06 
 
 
444 aa  89.7  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6514  hypothetical protein  23 
 
 
651 aa  89  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48888  predicted protein  27.85 
 
 
645 aa  86.7  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3525  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  27.31 
 
 
1672 aa  84.3  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2172  quinoprotein (ISS); K06485 integrin alpha 6  26.33 
 
 
431 aa  80.5  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  32.82 
 
 
554 aa  78.2  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2094  hypothetical protein  25.23 
 
 
410 aa  77.8  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.991915  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3770  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  26.64 
 
 
595 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707249 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0044  PKD domain-containing protein  26.89 
 
 
396 aa  50.8  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8620  hypothetical protein  30.16 
 
 
458 aa  48.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>