44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48888 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_48888  predicted protein  100 
 
 		 645 aa  1296    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46170  predicted protein  34.18 
 
 		 1069 aa  157  4e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0594  PKD domain-containing protein  30.9 
 
 		 466 aa  110  7.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46243  predicted protein  31.14 
 
 		 640 aa  104  6e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1055  hypothetical protein  31.34 
 
 		 666 aa  103  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00001121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  33.05 
 
 		 706 aa  103  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2403  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  27.85 
 
 		 659 aa  93.6  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000436928  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27 
 
 		 691 aa  88.6  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0686  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  28.74 
 
 		 680 aa  84.7  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45068  predicted protein  26.6 
 
 		 479 aa  82.4  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2051  hypothetical protein  25.72 
 
 		 460 aa  75.5  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.492002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1375  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  27.05 
 
 		 674 aa  75.1  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0423  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  29.54 
 
 		 824 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.657056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5100  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  29.61 
 
 		 548 aa  72.8  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908648  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  31.94 
 
 		 830 aa  72  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53961  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  34.36 
 
 		 668 aa  71.2  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2823  quinoprotein (ISS)  25.9 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1530  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  28.42 
 
 		 1537 aa  67.8  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2172  quinoprotein (ISS); K06485 integrin alpha 6  26.55 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2122  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  28.64 
 
 		 590 aa  67.4  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.553057  normal  0.356017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2123  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  26.72 
 
 		 587 aa  66.6  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.14818 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2786  hypothetical protein  26.92 
 
 		 740 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3525  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  27.12 
 
 		 1672 aa  65.1  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39253  predicted protein  29.8 
 
 		 1538 aa  62.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0892  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  26.25 
 
 		 682 aa  62  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1865  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  25.93 
 
 		 575 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6514  hypothetical protein  24.1 
 
 		 651 aa  58.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0377  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  25.96 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1931  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  26.42 
 
 		 684 aa  57.8  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195615  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1775  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  28.18 
 
 		 609 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910823  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0261  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  28.65 
 
 		 486 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  0.813855 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6754  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  25.73 
 
 		 627 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0323  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  25.76 
 
 		 449 aa  55.5  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0274075  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0596  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  25.63 
 
 		 680 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46171  predicted protein  27.75 
 
 		 469 aa  53.5  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1230  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  26.68 
 
 		 680 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.491664  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2195  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  24.34 
 
 		 676 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.848428  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5079  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  26.24 
 
 		 693 aa  52.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4056  hypothetical protein  28.42 
 
 		 1134 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.55653  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0343  hypothetical protein  28.44 
 
 		 913 aa  49.7  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5142  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  31.41 
 
 		 529 aa  45.8  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0225115  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0459  hypothetical protein  26.38 
 
 		 363 aa  45.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104382 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  27.2 
 
 		 2807 aa  44.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2802  hypothetical protein  29.84 
 
 		 841 aa  44.3  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>