40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5059 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009973  Haur_5059  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  100 
 
 		 406 aa  833    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.241627  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5100  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  44.99 
 
 		 548 aa  296  5e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908648  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0686  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  44.39 
 
 		 680 aa  283  5.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2403  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  41.93 
 
 		 659 aa  270  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000436928  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0892  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  41.93 
 
 		 682 aa  256  4e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1230  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  40.68 
 
 		 680 aa  251  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.491664  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0596  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  41.3 
 
 		 680 aa  250  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1375  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  39.74 
 
 		 674 aa  238  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 		 691 aa  219  7.999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2123  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  38.66 
 
 		 587 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.14818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5079  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  35.52 
 
 		 693 aa  213  7e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5142  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  38.32 
 
 		 529 aa  212  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0225115  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2195  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  39.75 
 
 		 676 aa  209  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.848428  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2122  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  36.72 
 
 		 590 aa  208  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.553057  normal  0.356017 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1931  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  37.53 
 
 		 684 aa  202  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195615  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1865  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  35.92 
 
 		 575 aa  199  7.999999999999999e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1775  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  36.26 
 
 		 609 aa  184  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910823  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1530  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  36.76 
 
 		 1537 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6754  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  31.75 
 
 		 627 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1055  hypothetical protein  30.17 
 
 		 666 aa  130  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00001121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1333  hypothetical protein  53.66 
 
 		 232 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0423  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  30 
 
 		 824 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.657056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  27.64 
 
 		 706 aa  103  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5056  hypothetical protein  76.12 
 
 		 143 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0377  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  28.84 
 
 		 404 aa  99.8  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  27.01 
 
 		 830 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0594  PKD domain-containing protein  25.32 
 
 		 466 aa  89.7  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0261  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  27.78 
 
 		 486 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  0.813855 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2094  hypothetical protein  28.33 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.991915  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6514  hypothetical protein  23.28 
 
 		 651 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2172  quinoprotein (ISS); K06485 integrin alpha 6  28.66 
 
 		 431 aa  54.7  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3525  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  26.57 
 
 		 1672 aa  52.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8620  hypothetical protein  26.78 
 
 		 458 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2823  quinoprotein (ISS)  25.22 
 
 		 444 aa  51.6  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0323  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  23.17 
 
 		 449 aa  51.6  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0274075  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3770  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  29.52 
 
 		 595 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707249 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0044  PKD domain-containing protein  26.3 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0791  hypothetical protein  24.87 
 
 		 692 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.195904  normal  0.0459938 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48888  predicted protein  22.5 
 
 		 645 aa  43.1  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39253  predicted protein  27.63 
 
 		 1538 aa  43.1  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>