41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4504 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  100 
 
 		 456 aa  904    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  58.87 
 
 		 453 aa  520  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1598  hypothetical protein  34.32 
 
 		 675 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000695683  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  52.11 
 
 		 1394 aa  110  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4466  hypothetical protein  43.52 
 
 		 412 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  51.09 
 
 		 625 aa  76.6  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  50 
 
 		 830 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  43.68 
 
 		 2604 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  49.32 
 
 		 605 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  50 
 
 		 916 aa  65.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0201  laminin G, domain-containing 2  65.12 
 
 		 793 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  36.24 
 
 		 2313 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  65.22 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  40.51 
 
 		 2353 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  51.52 
 
 		 1159 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3759  PT repeat-containing protein  42.42 
 
 		 259 aa  55.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  66 
 
 		 914 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  40.87 
 
 		 551 aa  55.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 356 aa  54.7  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  44.9 
 
 		 778 aa  54.7  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  42.86 
 
 		 671 aa  53.9  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1976  hypothetical protein  29.08 
 
 		 506 aa  52.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.41004  normal  0.344943 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0232  hypothetical protein  37.8 
 
 		 150 aa  53.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.204502 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  34.56 
 
 		 1096 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  42.5 
 
 		 555 aa  50.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0483  hypothetical protein  44.3 
 
 		 476 aa  50.1  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.105295 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1469  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.51 
 
 		 445 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854841  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  43.24 
 
 		 846 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8081  Serine/threonine protein kinase-like protein  37.37 
 
 		 769 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.887421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  37.88 
 
 		 504 aa  47.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  28.12 
 
 		 1000 aa  47.4  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.15 
 
 		 261 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  38.14 
 
 		 840 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48494  predicted protein  37.01 
 
 		 582 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.31 
 
 		 257 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  39.33 
 
 		 489 aa  44.3  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0063  peptidoglycan-binding LysM  65.31 
 
 		 202 aa  43.5  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0180593  normal  0.117773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3858  rhs element Vgr protein  37.28 
 
 		 258 aa  43.5  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2777  hypothetical protein  41.07 
 
 		 428 aa  43.5  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2289  peptidase M23B  32.17 
 
 		 457 aa  43.5  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000911471  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4658  mucin 2  42.86 
 
 		 794 aa  43.1  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0296531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>