50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4505 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  100 
 
 
453 aa  889    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  58.28 
 
 
456 aa  503  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1598  hypothetical protein  51.49 
 
 
675 aa  129  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000695683  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4466  hypothetical protein  43.52 
 
 
412 aa  103  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  52.91 
 
 
1394 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  41.88 
 
 
2604 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  50.71 
 
 
625 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  51.77 
 
 
2353 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  45.1 
 
 
830 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1976  hypothetical protein  36.76 
 
 
506 aa  73.2  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.41004  normal  0.344943 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  48.42 
 
 
268 aa  65.9  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  48.95 
 
 
605 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  40.41 
 
 
2313 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0232  hypothetical protein  37.25 
 
 
150 aa  60.5  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.204502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  40.45 
 
 
916 aa  58.9  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  51.16 
 
 
846 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  45.38 
 
 
555 aa  58.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  39.42 
 
 
1159 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0063  peptidoglycan-binding LysM  60.29 
 
 
202 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0180593  normal  0.117773 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  41.61 
 
 
671 aa  57  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1469  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  48.28 
 
 
445 aa  56.6  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854841  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  56.52 
 
 
455 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  33.66 
 
 
3472 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  33.66 
 
 
3471 aa  53.5  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  33.66 
 
 
3521 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  47 
 
 
778 aa  52.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  42.73 
 
 
551 aa  50.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3759  PT repeat-containing protein  55.7 
 
 
259 aa  50.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  57.35 
 
 
1281 aa  50.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  42.66 
 
 
504 aa  50.1  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  29.71 
 
 
1000 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  38.73 
 
 
840 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7673  protein kinase  45.24 
 
 
572 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683245  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0483  hypothetical protein  44.22 
 
 
476 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.105295 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42501  predicted protein  41.24 
 
 
755 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2777  hypothetical protein  48.08 
 
 
428 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  52.46 
 
 
914 aa  47  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48494  predicted protein  42.59 
 
 
582 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  32.21 
 
 
1096 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0201  laminin G, domain-containing 2  61.36 
 
 
793 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317242  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43450  predicted protein  28.49 
 
 
467 aa  44.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43691  predicted protein  43.31 
 
 
354 aa  45.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183589  normal  0.0384489 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49209  predicted protein  40.51 
 
 
526 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0370698  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3858  rhs element Vgr protein  43.92 
 
 
258 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4013  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 
203 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0332681  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50210  predicted protein  33.33 
 
 
521 aa  43.9  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.722754  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0580  hypothetical protein  62.5 
 
 
253 aa  43.5  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.306305  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45682  predicted protein  39.34 
 
 
633 aa  43.9  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  34.72 
 
 
329 aa  43.9  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  62.22 
 
 
1034 aa  43.5  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>