26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0679 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  100 
 
 		 625 aa  1147    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  53.82 
 
 		 605 aa  483  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  48.2 
 
 		 2353 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  46.13 
 
 		 2313 aa  160  9e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3047  hypothetical protein  38.5 
 
 		 986 aa  96.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.845635  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  43.59 
 
 		 830 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  40 
 
 		 1394 aa  77  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  48.53 
 
 		 453 aa  75.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43691  predicted protein  34.76 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183589  normal  0.0384489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3859  hypothetical protein  48.05 
 
 		 182 aa  66.6  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  34.81 
 
 		 1000 aa  65.5  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  37.6 
 
 		 671 aa  62.4  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43595  predicted protein  36.09 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.796402  normal  0.0151385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1715  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.88 
 
 		 473 aa  57.8  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3858  rhs element Vgr protein  42.57 
 
 		 258 aa  51.2  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1911  hypothetical protein  23.03 
 
 		 1934 aa  49.7  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.225892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  46.43 
 
 		 456 aa  48.9  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0483  hypothetical protein  36.4 
 
 		 476 aa  48.1  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.105295 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3759  PT repeat-containing protein  47.25 
 
 		 259 aa  47.4  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  32.32 
 
 		 916 aa  47.4  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  43.09 
 
 		 551 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  58.54 
 
 		 356 aa  46.6  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2176  restriction endonuclease  34.74 
 
 		 669 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  43.75 
 
 		 455 aa  45.8  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.44 
 
 		 257 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  44.55 
 
 		 778 aa  44.7  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>