33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0098 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  100 
 
 		 605 aa  1122    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  56.6 
 
 		 625 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  48.56 
 
 		 2353 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  38.68 
 
 		 2313 aa  121  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3047  hypothetical protein  43.5 
 
 		 986 aa  110  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.845635  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  47.14 
 
 		 830 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  47.91 
 
 		 1394 aa  82  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  25 
 
 		 2449 aa  78.2  0.0000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3859  hypothetical protein  53.75 
 
 		 182 aa  77.8  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  50.38 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  34.88 
 
 		 671 aa  62.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  53.01 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1715  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.14 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  38.46 
 
 		 916 aa  57  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2338  hypothetical protein  34.21 
 
 		 1977 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0483  hypothetical protein  37.1 
 
 		 476 aa  53.5  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.105295 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  58.57 
 
 		 356 aa  52  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0451  hypothetical protein  37.08 
 
 		 682 aa  50.4  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.935118  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3858  rhs element Vgr protein  43.29 
 
 		 258 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3142  spore coat assembly protein SafA  24.74 
 
 		 674 aa  49.3  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  31.03 
 
 		 1000 aa  48.5  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7673  protein kinase  40.19 
 
 		 572 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  29.41 
 
 		 344 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.96 
 
 		 257 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43691  predicted protein  35.48 
 
 		 354 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183589  normal  0.0384489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  60 
 
 		 771 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3759  PT repeat-containing protein  42.37 
 
 		 259 aa  46.2  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2176  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 669 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43595  predicted protein  34.54 
 
 		 329 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.796402  normal  0.0151385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8081  Serine/threonine protein kinase-like protein  41.67 
 
 		 769 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.887421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  47.06 
 
 		 551 aa  44.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0032  rhodanese-like protein  34.57 
 
 		 248 aa  44.3  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4013  peptidoglycan-binding LysM  52.86 
 
 		 203 aa  44.3  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0332681  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>