More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1715 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1715  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  100 
 
 
473 aa  914    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4601  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  53.26 
 
 
282 aa  243  6e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1084  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  50.72 
 
 
283 aa  239  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0125965  normal  0.0422522 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0381  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  53 
 
 
281 aa  231  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.217368  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.33 
 
 
286 aa  161  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353591  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1071  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  41.58 
 
 
279 aa  160  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.27418  hitchhiker  0.000721041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1248  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.39 
 
 
279 aa  155  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345391  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1177  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  42.18 
 
 
277 aa  150  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal  0.706287 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2554  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.42 
 
 
292 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9208  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase-like protein  42.58 
 
 
272 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.99398 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1967  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.11 
 
 
308 aa  121  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1563  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.65 
 
 
295 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.25531 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0094  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.79 
 
 
294 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1538  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.45 
 
 
294 aa  118  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  43.1 
 
 
936 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2365  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.72 
 
 
280 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304818  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0091  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.31 
 
 
294 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42855 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0416  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.97 
 
 
293 aa  113  9e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128844  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1344  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.1 
 
 
293 aa  111  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  41.28 
 
 
300 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2472  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.69 
 
 
280 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1998  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.38 
 
 
302 aa  107  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000898814  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.14 
 
 
281 aa  107  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3073  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.42 
 
 
282 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.419885  normal  0.223963 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1255  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.79 
 
 
293 aa  105  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.463201  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1727  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.21 
 
 
284 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.681532  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0494  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.89 
 
 
298 aa  104  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.346863  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1313  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.57 
 
 
276 aa  104  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3226  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.07 
 
 
300 aa  104  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1071  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.84 
 
 
285 aa  103  5e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.960229  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3653  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.71 
 
 
294 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  42.42 
 
 
606 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0588  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.29 
 
 
327 aa  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.749225 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2008  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.74 
 
 
723 aa  103  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0551  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.72 
 
 
307 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0589  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.43 
 
 
285 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0766528  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4111  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.6 
 
 
730 aa  101  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  37.5 
 
 
813 aa  101  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  41.15 
 
 
842 aa  100  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4815  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.95 
 
 
299 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.681272  normal  0.324066 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0381  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.24 
 
 
305 aa  99.8  9e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2324  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.62 
 
 
297 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.888846  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1420  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30 
 
 
279 aa  98.6  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1686  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.83 
 
 
285 aa  98.2  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2316  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.89 
 
 
297 aa  98.2  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0781595 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2262  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.72 
 
 
294 aa  98.2  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0328  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.46 
 
 
278 aa  98.2  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0715  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.62 
 
 
298 aa  97.1  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.466634 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  39.42 
 
 
462 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3414  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.83 
 
 
303 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4020  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.06 
 
 
730 aa  96.3  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0633  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.34 
 
 
285 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0452  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.87 
 
 
304 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0462  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.87 
 
 
304 aa  95.9  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0492  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.24 
 
 
296 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.37943 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1355  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.6 
 
 
287 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00158528  normal  0.708717 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0478  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.88 
 
 
296 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0881  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.12 
 
 
298 aa  95.1  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3878  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.87 
 
 
304 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3355  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.46 
 
 
296 aa  94.4  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.909711  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1336  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.6 
 
 
287 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.978104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1319  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.6 
 
 
287 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1493  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.85 
 
 
301 aa  94.4  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  38.05 
 
 
748 aa  94  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2019  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30 
 
 
738 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.240233  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2405  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31 
 
 
284 aa  93.6  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0306  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.55 
 
 
283 aa  93.6  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2828  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.47 
 
 
291 aa  93.2  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.39163  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4174  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.5 
 
 
306 aa  93.2  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1580  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.03 
 
 
278 aa  93.2  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1216  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.2 
 
 
296 aa  93.2  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.896826 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  33.48 
 
 
639 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3036  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.86 
 
 
283 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4291  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.87 
 
 
298 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1118  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.81 
 
 
284 aa  92.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000464599  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4736  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.19 
 
 
274 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.377015  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3018  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.64 
 
 
281 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2525  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.52 
 
 
298 aa  92  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2129  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.89 
 
 
286 aa  91.7  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0850  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.18 
 
 
314 aa  91.3  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1779  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.93 
 
 
297 aa  91.7  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00243798  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1138  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.81 
 
 
284 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131341  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  39.52 
 
 
1168 aa  90.9  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1231  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.81 
 
 
284 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  39.34 
 
 
706 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1299  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.81 
 
 
284 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423325 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1984  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.99 
 
 
301 aa  90.9  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1381  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.01 
 
 
291 aa  90.5  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.682696  hitchhiker  0.0000283984 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1338  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.11 
 
 
284 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.326275  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1750  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.44 
 
 
283 aa  90.1  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.963734 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2712  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.18 
 
 
291 aa  90.1  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0435  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.33 
 
 
297 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0436  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.6 
 
 
304 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1659  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.02 
 
 
277 aa  89.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1376  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.56 
 
 
284 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.580619  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0794  dTDP-4-keto-L-rhamnose reductase  26.92 
 
 
294 aa  89  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3709  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.41 
 
 
309 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3272  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.68 
 
 
276 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3463  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.1 
 
 
294 aa  88.2  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.585813  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0477  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.79 
 
 
279 aa  87.8  4e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  unclonable  0.0000000000065602  decreased coverage  0.00000000361225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>