138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4013 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4013  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 203 aa  381  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0063  peptidoglycan-binding LysM  65.9 
 
 		 202 aa  216  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0180593  normal  0.117773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1088  peptidoglycan-binding LysM  39.2 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155027  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0821  Peptidoglycan-binding LysM  29.41 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0727806 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1855  Peptidoglycan-binding LysM  38.02 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  50.91 
 
 		 1281 aa  55.5  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  41.18 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  35.07 
 
 		 447 aa  53.5  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  50.68 
 
 		 301 aa  53.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21400  Peptidoglycan-binding LysM  51.85 
 
 		 500 aa  52.8  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  45.45 
 
 		 587 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0425  peptidoglycan-binding LysM  42.67 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00647142  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1069  peptidoglycan-binding LysM  43.48 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  54.35 
 
 		 509 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0521  LysM/M23 peptidase  35.63 
 
 		 397 aa  48.5  0.00006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.939953  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  40.62 
 
 		 466 aa  48.5  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21410  Peptidoglycan-binding LysM  57.45 
 
 		 530 aa  48.5  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  31.9 
 
 		 938 aa  48.1  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  43.55 
 
 		 412 aa  47.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0570  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.3 
 
 		 452 aa  47.4  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000754253 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  62.9 
 
 		 2353 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  30.61 
 
 		 727 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  51.79 
 
 		 356 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  50 
 
 		 427 aa  46.6  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3908  lytic transglycosylase catalytic  31.36 
 
 		 544 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0496507 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  46.81 
 
 		 528 aa  47  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  32.31 
 
 		 733 aa  47  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.62 
 
 		 422 aa  46.6  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  41.79 
 
 		 290 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  30.61 
 
 		 727 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  50.88 
 
 		 620 aa  46.2  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3737  MltD domain-containing protein  47.92 
 
 		 483 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0625  MltD domain-containing protein  47.92 
 
 		 483 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0652  MltD domain-containing protein  47.92 
 
 		 483 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2915  Peptidoglycan-binding LysM  39.24 
 
 		 393 aa  46.2  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.992614  hitchhiker  0.000000148718 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0648  MLTD_N domain protein  47.92 
 
 		 483 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  47.17 
 
 		 261 aa  46.2  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2994  peptidoglycan-binding protein  32.31 
 
 		 467 aa  45.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0876  stage VI sporulation protein D  53.33 
 
 		 351 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3257  lytic transglycosylase, catalytic  45.83 
 
 		 471 aa  45.8  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1982  LysM domain-containing protein  43.48 
 
 		 184 aa  45.4  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1838  peptidoglycan-binding LysM  34.35 
 
 		 443 aa  45.8  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.858327  unclonable  0.000000000675364 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4610  peptidase M23  48.08 
 
 		 788 aa  45.8  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000163265  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  50 
 
 		 310 aa  45.4  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  42.55 
 
 		 527 aa  45.4  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1274  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.06 
 
 		 497 aa  45.4  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.730541  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  34.48 
 
 		 2449 aa  45.4  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 503 aa  45.4  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  36.76 
 
 		 667 aa  45.4  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  47.17 
 
 		 515 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  50 
 
 		 427 aa  45.1  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03310  Peptidoglycan-binding LysM  47.83 
 
 		 523 aa  45.1  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  52.86 
 
 		 605 aa  45.1  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1716  peptidoglycan-binding LysM  40.58 
 
 		 597 aa  45.1  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.925679  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  47.83 
 
 		 394 aa  45.1  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2218  Lytic transglycosylase catalytic  45.33 
 
 		 618 aa  45.1  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.70593 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3707  transglutaminase domain-containing protein  42.86 
 
 		 876 aa  44.7  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  54.35 
 
 		 285 aa  45.1  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  47.83 
 
 		 438 aa  44.7  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  47.83 
 
 		 754 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0538  MltD domain-containing protein  39.58 
 
 		 474 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65370  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  50 
 
 		 475 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0527105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3028  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.57 
 
 		 435 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0809739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  54.55 
 
 		 499 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  43.48 
 
 		 423 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1782  Mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosami dase  36.99 
 
 		 300 aa  44.3  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1413  peptidoglycan-binding LysM  45.65 
 
 		 323 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00299984  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1670  protein kinase  64.44 
 
 		 1073 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375386 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  46.67 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  75.76 
 
 		 1034 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3974  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.02 
 
 		 270 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000260277  unclonable  0.000000000113169 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4173  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.59 
 
 		 439 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  50 
 
 		 534 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4017  Slt family transglycosylase  43.75 
 
 		 477 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1945  lytic transglycosylase  50 
 
 		 445 aa  43.5  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106918  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  38.71 
 
 		 546 aa  43.9  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3414  MltD domain-containing protein  39.58 
 
 		 474 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.387896 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3314  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.74 
 
 		 447 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000664916  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0538  muramidase (flagellum-specific)  30.77 
 
 		 361 aa  43.9  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000149562  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0326  muramidase  54.76 
 
 		 372 aa  43.5  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000174883  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  52.17 
 
 		 289 aa  43.5  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  54.24 
 
 		 625 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0794  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.9 
 
 		 440 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345459 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3543  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.29 
 
 		 440 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 445 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  47.83 
 
 		 538 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  42.37 
 
 		 530 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  45.65 
 
 		 751 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2988  lytic transglycosylase  43.4 
 
 		 503 aa  43.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3584  MltD domain-containing protein  39.58 
 
 		 474 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0669  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.88 
 
 		 430 aa  43.1  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 		 327 aa  42.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  45.28 
 
 		 341 aa  42.7  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0021  Peptidoglycan-binding LysM  51.11 
 
 		 522 aa  42.4  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0147  cell wall hydrolase  43.48 
 
 		 265 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2402  peptidoglycan-binding LysM  47.83 
 
 		 522 aa  42.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  39.68 
 
 		 314 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6909  Mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosami dase  34.56 
 
 		 619 aa  42.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.490682  normal  0.152044 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  41.07 
 
 		 179 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>