95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0267 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  100 
 
 		 671 aa  1323    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0404  type 3a, cellulose-binding  29.63 
 
 		 522 aa  241  5e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0894635  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3368  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  45.22 
 
 		 919 aa  143  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00223117  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  45.62 
 
 		 985 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0071  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.55 
 
 		 938 aa  142  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2119  glycoside hydrolase family protein  29.29 
 
 		 760 aa  140  7e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  40.53 
 
 		 857 aa  134  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0316  PA14  32.28 
 
 		 644 aa  130  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.914268  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35.12 
 
 		 887 aa  128  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0271  type 3a, cellulose-binding  41.25 
 
 		 308 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.817907  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3077  cellulosome anchoring protein, cohesin region  37.19 
 
 		 1853 aa  120  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1740  hypothetical protein  34.51 
 
 		 413 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0059  type 3a, cellulose-binding  30.04 
 
 		 486 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0360636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  35.5 
 
 		 928 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0260  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.82 
 
 		 707 aa  100  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.500481  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  35.63 
 
 		 2344 aa  97.8  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  35.33 
 
 		 961 aa  97.1  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  34.9 
 
 		 949 aa  96.3  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2974  hypothetical protein  26.89 
 
 		 403 aa  95.9  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  44.05 
 
 		 830 aa  88.6  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  32.58 
 
 		 1013 aa  88.2  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  31.76 
 
 		 1121 aa  86.7  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  36.42 
 
 		 1759 aa  86.7  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  36.25 
 
 		 2313 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0073  hypothetical protein  27.07 
 
 		 330 aa  86.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  31.9 
 
 		 1017 aa  86.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  47.18 
 
 		 916 aa  86.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  36.42 
 
 		 1478 aa  85.5  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  36.42 
 
 		 1294 aa  85.1  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1257  carbohydrate-binding, CenC-like protein  31.48 
 
 		 1050 aa  85.1  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35.76 
 
 		 833 aa  85.1  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  35.19 
 
 		 1414 aa  84  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0728  cellulosome anchoring protein cohesin region  29.76 
 
 		 1546 aa  84  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7202  type 3a cellulose-binding domain protein  31.37 
 
 		 473 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  34.97 
 
 		 660 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2308  hypothetical protein  30.05 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  29.81 
 
 		 763 aa  81.6  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1273  alpha-L-arabinofuranosidase B  27.66 
 
 		 481 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2037  hypothetical protein  25 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0662  hypothetical protein  26.95 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00226884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  27.98 
 
 		 1298 aa  75.9  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9095  hypothetical protein  29.81 
 
 		 467 aa  74.7  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  32.62 
 
 		 505 aa  72.4  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3360  hypothetical protein  26.97 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  33.13 
 
 		 1369 aa  71.2  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  33.33 
 
 		 505 aa  71.2  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  38.46 
 
 		 1394 aa  70.5  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  31.18 
 
 		 1904 aa  70.5  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  43.4 
 
 		 625 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1697  hypothetical protein  28.92 
 
 		 411 aa  70.5  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.600188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  46.09 
 
 		 453 aa  67.8  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  26.88 
 
 		 619 aa  67.8  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  29.22 
 
 		 678 aa  67.4  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1642  type 3a cellulose-binding domain protein  29.55 
 
 		 658 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  37.54 
 
 		 2353 aa  57.4  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1814  hypothetical protein  24.24 
 
 		 428 aa  57  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3432  hypothetical protein  24.24 
 
 		 444 aa  57  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0833  conserved hypothetical membrane associated protein  26.92 
 
 		 349 aa  56.2  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2111  hypothetical protein  23.55 
 
 		 288 aa  56.6  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  37.01 
 
 		 840 aa  55.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3482  hypothetical protein  28.57 
 
 		 440 aa  55.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.381861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3203  membrane associated protein  27.85 
 
 		 426 aa  55.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220065  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  51.47 
 
 		 433 aa  55.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3440  hypothetical protein  28.48 
 
 		 503 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.177928  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3444  hypothetical protein  28.57 
 
 		 438 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3230  hypothetical protein  28.57 
 
 		 441 aa  55.1  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3136  membrane associated protein  28.57 
 
 		 456 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45682  predicted protein  38.37 
 
 		 633 aa  54.3  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4760  hypothetical protein  24.48 
 
 		 450 aa  53.5  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00173239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3121  hypothetical protein  24.56 
 
 		 457 aa  52.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0295714  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  35.94 
 
 		 555 aa  52.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  34.34 
 
 		 504 aa  52.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  50.82 
 
 		 1281 aa  52.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2522  membrane associated protein  25.6 
 
 		 540 aa  52.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0879988  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1806  hypothetical protein  40.62 
 
 		 100 aa  51.6  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  24.49 
 
 		 1224 aa  51.6  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.9 
 
 		 257 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  41.57 
 
 		 489 aa  49.7  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  60.47 
 
 		 1034 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  36.42 
 
 		 605 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  32.17 
 
 		 407 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1281  hypothetical protein  56.82 
 
 		 430 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.197658 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4317  YadA domain-containing protein  37.6 
 
 		 427 aa  46.6  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.130798  normal  0.0481736 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 356 aa  46.6  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1493  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  33.98 
 
 		 633 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0483  hypothetical protein  27.38 
 
 		 3754 aa  46.2  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.38288 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30179  hypothetical protein  39.84 
 
 		 617 aa  46.2  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0761319 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1598  hypothetical protein  37.01 
 
 		 675 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000695683  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  55.32 
 
 		 771 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3759  PT repeat-containing protein  45 
 
 		 259 aa  45.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0580  hypothetical protein  50 
 
 		 253 aa  45.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.306305  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  31.13 
 
 		 551 aa  45.4  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1585  hypothetical protein  24.9 
 
 		 332 aa  45.1  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  43.53 
 
 		 456 aa  44.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0528  hypothetical protein  52.38 
 
 		 431 aa  43.9  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.16882 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>