30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2308 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2308  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  785    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3360  hypothetical protein  29.18 
 
 		 363 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4760  hypothetical protein  25.63 
 
 		 450 aa  86.7  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00173239  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0073  hypothetical protein  24.52 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1585  hypothetical protein  25.24 
 
 		 332 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0260  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.02 
 
 		 707 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.500481  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  28.81 
 
 		 671 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1740  hypothetical protein  25.9 
 
 		 413 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0833  conserved hypothetical membrane associated protein  28.3 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0404  type 3a, cellulose-binding  26.6 
 
 		 522 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0894635  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3432  hypothetical protein  27.06 
 
 		 444 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2522  membrane associated protein  22.27 
 
 		 540 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0879988  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0059  type 3a, cellulose-binding  25.91 
 
 		 486 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0360636  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1814  hypothetical protein  27.06 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2119  glycoside hydrolase family protein  27.17 
 
 		 760 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1697  hypothetical protein  25.43 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.600188 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1273  alpha-L-arabinofuranosidase B  25.5 
 
 		 481 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0662  hypothetical protein  22.33 
 
 		 444 aa  66.2  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00226884  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3230  hypothetical protein  26.15 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3440  hypothetical protein  25.82 
 
 		 503 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.177928  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3121  hypothetical protein  24.78 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0295714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3203  membrane associated protein  25.69 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220065  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3482  hypothetical protein  26.15 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.381861  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3444  hypothetical protein  25.69 
 
 		 438 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3136  membrane associated protein  25.69 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0316  PA14  23.85 
 
 		 644 aa  63.2  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.914268  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2974  hypothetical protein  22.58 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0591  hypothetical protein  26.09 
 
 		 271 aa  51.6  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000298116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2037  hypothetical protein  27.61 
 
 		 376 aa  51.6  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1806  hypothetical protein  38.98 
 
 		 100 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>