35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2522 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2522  membrane associated protein  100 
 
 		 540 aa  1070    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0879988  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2119  glycoside hydrolase family protein  28 
 
 		 760 aa  95.1  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1814  hypothetical protein  30.04 
 
 		 428 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3136  membrane associated protein  27.66 
 
 		 456 aa  87  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3444  hypothetical protein  27.66 
 
 		 438 aa  87  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3203  membrane associated protein  29.57 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3432  hypothetical protein  30.04 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0833  conserved hypothetical membrane associated protein  24.05 
 
 		 349 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3482  hypothetical protein  27.3 
 
 		 440 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.381861  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3230  hypothetical protein  27.3 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1740  hypothetical protein  24.9 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3360  hypothetical protein  28.21 
 
 		 363 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0073  hypothetical protein  27.31 
 
 		 330 aa  79.3  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3440  hypothetical protein  27.03 
 
 		 503 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.177928  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4760  hypothetical protein  22.55 
 
 		 450 aa  75.1  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00173239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3121  hypothetical protein  27.91 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0295714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2308  hypothetical protein  22.27 
 
 		 387 aa  72  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0059  type 3a, cellulose-binding  23.94 
 
 		 486 aa  70.5  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0360636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1273  alpha-L-arabinofuranosidase B  23.62 
 
 		 481 aa  63.5  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0316  PA14  19.92 
 
 		 644 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.914268  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0404  type 3a, cellulose-binding  25.28 
 
 		 522 aa  58.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0894635  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0260  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.63 
 
 		 707 aa  58.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.500481  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0591  hypothetical protein  23.95 
 
 		 271 aa  55.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000298116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1697  hypothetical protein  27.14 
 
 		 411 aa  56.2  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.600188 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0662  hypothetical protein  31.78 
 
 		 444 aa  55.1  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00226884  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2000  hypothetical protein  51.02 
 
 		 333 aa  50.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2149  hypothetical protein  51.02 
 
 		 333 aa  50.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  51.02 
 
 		 332 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  51.02 
 
 		 330 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2154  excalibur domain family  49.02 
 
 		 287 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  51.02 
 
 		 331 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  27.78 
 
 		 671 aa  48.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  48.98 
 
 		 334 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2037  hypothetical protein  23.02 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2614  hypothetical protein  25 
 
 		 337 aa  43.5  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>