29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1740 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1740  hypothetical protein  100 
 
 
413 aa  811    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0316  PA14  32.05 
 
 
644 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.914268  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  33.33 
 
 
671 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2119  glycoside hydrolase family protein  29.84 
 
 
760 aa  106  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0059  type 3a, cellulose-binding  30.68 
 
 
486 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0360636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1273  alpha-L-arabinofuranosidase B  30.89 
 
 
481 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0404  type 3a, cellulose-binding  29.62 
 
 
522 aa  94.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0894635  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3360  hypothetical protein  28.57 
 
 
363 aa  90.1  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651138  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0073  hypothetical protein  28.63 
 
 
330 aa  89.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3482  hypothetical protein  26.03 
 
 
440 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.381861  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3230  hypothetical protein  26.94 
 
 
441 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3440  hypothetical protein  26.82 
 
 
503 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.177928  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3444  hypothetical protein  29.3 
 
 
438 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3136  membrane associated protein  29.3 
 
 
456 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3203  membrane associated protein  30.57 
 
 
426 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220065  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0260  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.69 
 
 
707 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.500481  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4760  hypothetical protein  25.13 
 
 
450 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00173239  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1697  hypothetical protein  24.24 
 
 
411 aa  83.2  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.600188 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2974  hypothetical protein  25.62 
 
 
403 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2522  membrane associated protein  24.9 
 
 
540 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0879988  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3121  hypothetical protein  25.91 
 
 
457 aa  79  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0295714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1814  hypothetical protein  29.01 
 
 
428 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3432  hypothetical protein  29.01 
 
 
444 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2308  hypothetical protein  25.9 
 
 
387 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0662  hypothetical protein  24.6 
 
 
444 aa  71.6  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00226884  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1585  hypothetical protein  24.52 
 
 
332 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0591  hypothetical protein  25.16 
 
 
271 aa  59.3  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000298116  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0833  conserved hypothetical membrane associated protein  22.98 
 
 
349 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2037  hypothetical protein  20.94 
 
 
376 aa  56.6  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>