46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2974 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2974  hypothetical protein  100 
 
 		 403 aa  778    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2119  glycoside hydrolase family protein  30.95 
 
 		 760 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0316  PA14  30.89 
 
 		 644 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.914268  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  25.12 
 
 		 671 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0404  type 3a, cellulose-binding  30.96 
 
 		 522 aa  103  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0894635  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1740  hypothetical protein  26.97 
 
 		 413 aa  95.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1273  alpha-L-arabinofuranosidase B  30.68 
 
 		 481 aa  90.9  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0059  type 3a, cellulose-binding  23.55 
 
 		 486 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0360636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0260  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.64 
 
 		 707 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.500481  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2037  hypothetical protein  22.22 
 
 		 376 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  40.98 
 
 		 1056 aa  69.7  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2308  hypothetical protein  24.5 
 
 		 387 aa  67  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0145  TolA domain-containing protein  60.71 
 
 		 497 aa  59.3  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3203  membrane associated protein  24.05 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3432  hypothetical protein  24.68 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0662  hypothetical protein  20.24 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00226884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  36.62 
 
 		 3400 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3482  hypothetical protein  24.05 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.381861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3136  membrane associated protein  24.05 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3230  hypothetical protein  24.05 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3444  hypothetical protein  24.05 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3360  hypothetical protein  25.63 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  46.43 
 
 		 848 aa  57  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0073  hypothetical protein  26.61 
 
 		 330 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3121  hypothetical protein  23.75 
 
 		 457 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0295714  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3440  hypothetical protein  24.38 
 
 		 503 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.177928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1814  hypothetical protein  24.05 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1420  hypothetical protein  40.38 
 
 		 346 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0186857  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0833  conserved hypothetical membrane associated protein  29.75 
 
 		 349 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50390  probable cell surface glycoprotein  46.43 
 
 		 623 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151497  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4760  hypothetical protein  20.88 
 
 		 450 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00173239  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  42.53 
 
 		 2179 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2522  membrane associated protein  22.37 
 
 		 540 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0879988  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5164  hypothetical protein  35.85 
 
 		 276 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.830633  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0982  cell wall anchor domain-containing protein  47.06 
 
 		 2136 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4019  Acyl transferase  45.65 
 
 		 5526 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.25 
 
 		 793 aa  46.6  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  47.06 
 
 		 2272 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  47.37 
 
 		 680 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2111  hypothetical protein  23.27 
 
 		 288 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1585  hypothetical protein  25.95 
 
 		 332 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  27.61 
 
 		 1436 aa  45.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5504  hypothetical protein  40.62 
 
 		 1249 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6484  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.18 
 
 		 1257 aa  43.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1261 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1806  hypothetical protein  45.31 
 
 		 685 aa  43.1  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>