27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4760 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4760  hypothetical protein  100 
 
 
450 aa  910    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00173239  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3360  hypothetical protein  25.32 
 
 
363 aa  96.3  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651138  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0073  hypothetical protein  26.61 
 
 
330 aa  87.4  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0833  conserved hypothetical membrane associated protein  30.8 
 
 
349 aa  87.4  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2308  hypothetical protein  26.47 
 
 
387 aa  86.7  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1740  hypothetical protein  26.29 
 
 
413 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1697  hypothetical protein  29.96 
 
 
411 aa  79.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.600188 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0260  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.75 
 
 
707 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.500481  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2119  glycoside hydrolase family protein  25.73 
 
 
760 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3230  hypothetical protein  28.97 
 
 
441 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3136  membrane associated protein  28.97 
 
 
456 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3482  hypothetical protein  28.97 
 
 
440 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.381861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3203  membrane associated protein  29.44 
 
 
426 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220065  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2522  membrane associated protein  22.55 
 
 
540 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0879988  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0662  hypothetical protein  24.49 
 
 
444 aa  74.7  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00226884  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0316  PA14  26.94 
 
 
644 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.914268  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1814  hypothetical protein  26.55 
 
 
428 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0059  type 3a, cellulose-binding  26.61 
 
 
486 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0360636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3440  hypothetical protein  27.49 
 
 
503 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.177928  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3121  hypothetical protein  27.8 
 
 
457 aa  63.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0295714  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1273  alpha-L-arabinofuranosidase B  24.89 
 
 
481 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0591  hypothetical protein  25.5 
 
 
271 aa  53.9  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000298116  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1585  hypothetical protein  20.48 
 
 
332 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  27.4 
 
 
671 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0404  type 3a, cellulose-binding  20.34 
 
 
522 aa  46.6  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0894635  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1806  hypothetical protein  31.67 
 
 
100 aa  45.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0945  hypothetical protein  24.82 
 
 
377 aa  43.5  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000150754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>