29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2037 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2037  hypothetical protein  100 
 
 
376 aa  750    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2119  glycoside hydrolase family protein  28.24 
 
 
760 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1273  alpha-L-arabinofuranosidase B  25.85 
 
 
481 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  25.31 
 
 
671 aa  93.6  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3360  hypothetical protein  25.73 
 
 
363 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651138  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0073  hypothetical protein  24.89 
 
 
330 aa  86.3  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2974  hypothetical protein  21.05 
 
 
403 aa  82.8  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1740  hypothetical protein  20.76 
 
 
413 aa  82  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0662  hypothetical protein  23.06 
 
 
444 aa  77.4  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00226884  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0404  type 3a, cellulose-binding  23.41 
 
 
522 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0894635  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3203  membrane associated protein  27.27 
 
 
426 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3444  hypothetical protein  27.98 
 
 
438 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0059  type 3a, cellulose-binding  22.71 
 
 
486 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0360636  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3136  membrane associated protein  27.27 
 
 
456 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3482  hypothetical protein  29.87 
 
 
440 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.381861  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3230  hypothetical protein  29.49 
 
 
441 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0316  PA14  20.16 
 
 
644 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.914268  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3432  hypothetical protein  25.11 
 
 
444 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2522  membrane associated protein  19.93 
 
 
540 aa  66.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0879988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1814  hypothetical protein  26.03 
 
 
428 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2308  hypothetical protein  24.66 
 
 
387 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0833  conserved hypothetical membrane associated protein  27.5 
 
 
349 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3121  hypothetical protein  24.77 
 
 
457 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0295714  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3440  hypothetical protein  28.57 
 
 
503 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.177928  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0260  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  22.01 
 
 
707 aa  57.4  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.500481  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4760  hypothetical protein  21.27 
 
 
450 aa  56.2  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00173239  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1697  hypothetical protein  30.92 
 
 
411 aa  54.3  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.600188 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2111  hypothetical protein  25.46 
 
 
288 aa  52.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0591  hypothetical protein  40.74 
 
 
271 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000298116  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>