166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2119 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2119  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 760 aa  1565    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  57.22 
 
 		 639 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2105  xylanase  31.73 
 
 		 674 aa  189  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3704  glycoside hydrolase family protein  31.42 
 
 		 417 aa  187  6e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1074  glycoside hydrolase family 10  31.81 
 
 		 498 aa  178  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3209  glycoside hydrolase family protein  31.84 
 
 		 606 aa  155  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.818517  normal  0.245162 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0316  PA14  28.99 
 
 		 644 aa  146  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.914268  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2172  glycoside hydrolase family 10  30.49 
 
 		 482 aa  142  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0988  glycoside hydrolase family 10  27.83 
 
 		 975 aa  141  4.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.661558  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0323  TonB-like  27.29 
 
 		 670 aa  140  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000416946  normal  0.597274 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0260  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.23 
 
 		 707 aa  134  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.500481  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  29.29 
 
 		 671 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2392  Fibronectin type III domain protein  26.16 
 
 		 831 aa  132  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0896  glycoside hydrolase family 10  28.88 
 
 		 434 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0059  type 3a, cellulose-binding  28.03 
 
 		 486 aa  127  9e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0360636  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  28.25 
 
 		 423 aa  122  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  27.65 
 
 		 837 aa  114  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  29.5 
 
 		 457 aa  113  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  30.07 
 
 		 454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2391  Fibronectin type III domain protein  24.5 
 
 		 748 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.999424  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1273  alpha-L-arabinofuranosidase B  30.8 
 
 		 481 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  30.4 
 
 		 497 aa  112  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  27.52 
 
 		 541 aa  110  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  28.47 
 
 		 309 aa  110  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2370  glycosy hydrolase family protein  24.69 
 
 		 457 aa  110  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249901  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  28.99 
 
 		 820 aa  110  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  29.25 
 
 		 323 aa  108  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  28.46 
 
 		 678 aa  108  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  29.15 
 
 		 474 aa  108  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  26.87 
 
 		 490 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  28.04 
 
 		 756 aa  106  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  28.26 
 
 		 474 aa  107  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1740  hypothetical protein  29.82 
 
 		 413 aa  107  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  26.47 
 
 		 487 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  29.15 
 
 		 333 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  28.73 
 
 		 829 aa  105  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  25.83 
 
 		 488 aa  104  7e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0404  type 3a, cellulose-binding  28.15 
 
 		 522 aa  103  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0894635  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  27.47 
 
 		 457 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  28.62 
 
 		 451 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  27.99 
 
 		 495 aa  102  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  26.46 
 
 		 503 aa  103  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  26.94 
 
 		 778 aa  102  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2974  hypothetical protein  31.21 
 
 		 403 aa  101  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0181  Beta-1 4-xylanase-like  27.2 
 
 		 574 aa  100  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  32.05 
 
 		 1041 aa  100  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3662  glycoside hydrolase family protein  24.75 
 
 		 451 aa  100  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132636  normal  0.859273 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  31.42 
 
 		 376 aa  99  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  28.16 
 
 		 398 aa  98.6  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  27.04 
 
 		 477 aa  98.6  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  30.18 
 
 		 451 aa  98.2  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  26.17 
 
 		 491 aa  97.8  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01610  beta-1,4-xylanase  23.54 
 
 		 415 aa  96.7  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  28.62 
 
 		 472 aa  95.9  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2522  membrane associated protein  28 
 
 		 540 aa  95.1  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0879988  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  33.17 
 
 		 371 aa  95.1  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  28.57 
 
 		 383 aa  95.1  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  27.13 
 
 		 370 aa  94  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  25.36 
 
 		 815 aa  94  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  28.9 
 
 		 347 aa  93.6  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  28.3 
 
 		 370 aa  93.6  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  27.82 
 
 		 347 aa  91.7  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  25 
 
 		 357 aa  91.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2962  glycoside hydrolase family 10  24.74 
 
 		 357 aa  90.9  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0820888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  25.84 
 
 		 399 aa  90.9  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1433  glycoside hydrolase family 10  23.65 
 
 		 433 aa  90.1  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.43821  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  29.69 
 
 		 324 aa  89.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2724  glycoside hydrolase family 10  23.86 
 
 		 408 aa  89.7  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.85294  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3360  hypothetical protein  26.4 
 
 		 363 aa  89  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0012  glycoside hydrolase family 10  23.89 
 
 		 417 aa  89  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.577284 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  26.17 
 
 		 1037 aa  87.4  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  24 
 
 		 628 aa  87  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0073  hypothetical protein  26.83 
 
 		 330 aa  86.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2037  hypothetical protein  27.45 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  26.69 
 
 		 1059 aa  85.5  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  26.69 
 
 		 1059 aa  85.5  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  29.9 
 
 		 375 aa  85.9  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2369  glycosy hydrolase family protein  24.57 
 
 		 1014 aa  85.1  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  27.12 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  26.09 
 
 		 1001 aa  85.1  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  26.97 
 
 		 689 aa  84.7  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  24.19 
 
 		 997 aa  84  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  26.26 
 
 		 1414 aa  83.6  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  23.28 
 
 		 373 aa  83.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  29.27 
 
 		 366 aa  84  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  25.97 
 
 		 364 aa  82.8  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1373  glycoside hydrolase family protein  25.93 
 
 		 382 aa  82.4  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0283938 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  23.74 
 
 		 465 aa  82.4  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  26.55 
 
 		 486 aa  82.4  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  27.14 
 
 		 543 aa  82.4  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  25.11 
 
 		 1186 aa  81.6  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  23.66 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  26.87 
 
 		 338 aa  80.5  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  26.77 
 
 		 394 aa  79.3  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3590  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 325 aa  79  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.013688  hitchhiker  0.00813315 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  25.48 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  28.57 
 
 		 1020 aa  77.4  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03861  glycosyl hydrolase family 10  25 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260596  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  28.74 
 
 		 912 aa  76.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>