124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3590 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3590  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
325 aa  672    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.013688  hitchhiker  0.00813315 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03861  glycosyl hydrolase family 10  66.98 
 
 
325 aa  449  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260596  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  49.28 
 
 
721 aa  347  1e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03863  glycosyl hydrolase family 10  60.78 
 
 
271 aa  333  3e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  50.95 
 
 
997 aa  315  9e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  40.13 
 
 
541 aa  258  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  40.61 
 
 
1186 aa  233  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0181  Beta-1 4-xylanase-like  39.81 
 
 
574 aa  233  4.0000000000000004e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  32.53 
 
 
1247 aa  176  4e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  32.21 
 
 
1414 aa  174  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  29.39 
 
 
820 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  29.6 
 
 
488 aa  107  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  30.9 
 
 
543 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  29.33 
 
 
423 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  29.75 
 
 
497 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  30.8 
 
 
491 aa  103  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  28.72 
 
 
477 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  32.87 
 
 
678 aa  100  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  28.62 
 
 
333 aa  100  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  26.19 
 
 
347 aa  99.8  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  30.1 
 
 
457 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  26.19 
 
 
347 aa  99.8  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  29.69 
 
 
639 aa  98.2  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  28.48 
 
 
454 aa  97.1  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  27.52 
 
 
495 aa  96.3  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2105  xylanase  28.06 
 
 
674 aa  94  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  27.76 
 
 
487 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  24.17 
 
 
371 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  30.85 
 
 
474 aa  90.5  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  27.14 
 
 
457 aa  90.5  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  28.76 
 
 
756 aa  90.1  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3704  glycoside hydrolase family protein  27.62 
 
 
417 aa  89.4  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  27.63 
 
 
829 aa  89.4  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  27.22 
 
 
474 aa  89.4  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  26.6 
 
 
815 aa  88.6  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.538992 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  27.7 
 
 
309 aa  87.8  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  26.54 
 
 
373 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  28.87 
 
 
503 aa  87.8  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  28.85 
 
 
398 aa  87.4  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  28.62 
 
 
806 aa  87.4  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  26.79 
 
 
1018 aa  87.4  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  26.46 
 
 
490 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  26.6 
 
 
321 aa  87  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  28.75 
 
 
778 aa  85.9  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  25 
 
 
357 aa  85.9  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  26.81 
 
 
366 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  29.39 
 
 
912 aa  84.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  25.82 
 
 
407 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  28.19 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  28.85 
 
 
628 aa  83.2  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  25.61 
 
 
337 aa  82.4  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  28.85 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  27.36 
 
 
451 aa  80.1  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  26.52 
 
 
472 aa  79.7  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  25.29 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  27.05 
 
 
1019 aa  79.3  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2119  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 
760 aa  79  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  27.01 
 
 
370 aa  79  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  26.95 
 
 
373 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  24.28 
 
 
689 aa  77.8  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  28.79 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1074  glycoside hydrolase family 10  28.03 
 
 
498 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  26.43 
 
 
338 aa  77  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  27.78 
 
 
423 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  25.48 
 
 
756 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  29.9 
 
 
770 aa  76.3  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  29.63 
 
 
2457 aa  75.9  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  25.09 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  27.3 
 
 
1001 aa  75.5  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  25.36 
 
 
837 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  25.55 
 
 
1037 aa  74.7  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  26.95 
 
 
370 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  26.6 
 
 
383 aa  73.9  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2962  glycoside hydrolase family 10  26.47 
 
 
357 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0820888  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  25.4 
 
 
465 aa  73.2  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1373  glycoside hydrolase family protein  24.66 
 
 
382 aa  72.8  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0283938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  29.46 
 
 
375 aa  72.8  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  26.35 
 
 
376 aa  72  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  27.45 
 
 
389 aa  71.6  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3662  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 
451 aa  70.5  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132636  normal  0.859273 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  28.38 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  25.66 
 
 
619 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  24.65 
 
 
1041 aa  68.9  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  25.27 
 
 
1059 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  25.27 
 
 
1059 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  26.13 
 
 
368 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  29.08 
 
 
451 aa  66.6  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  22.87 
 
 
364 aa  66.2  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.98 
 
 
697 aa  66.2  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  24.68 
 
 
1478 aa  66.2  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35732  Glycoside hydrolase, family 10 Endo-1,4-beta-xylanase precursor (Xylanase) Exoglucanase/xylanase precursor  24.91 
 
 
321 aa  64.3  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  22.87 
 
 
369 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  22.85 
 
 
1050 aa  63.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  23.87 
 
 
331 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  25.78 
 
 
382 aa  63.9  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2253  glycoside hydrolase family 10  24.19 
 
 
381 aa  63.2  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0896  glycoside hydrolase family 10  26.37 
 
 
434 aa  63.5  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  23.08 
 
 
324 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  26.34 
 
 
374 aa  63.2  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  25 
 
 
394 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>