122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0896 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0896  glycoside hydrolase family 10  100 
 
 		 434 aa  882    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0323  TonB-like  38.76 
 
 		 670 aa  270  4e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000416946  normal  0.597274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3209  glycoside hydrolase family protein  38.29 
 
 		 606 aa  256  5e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.818517  normal  0.245162 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1074  glycoside hydrolase family 10  38.59 
 
 		 498 aa  242  7e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2172  glycoside hydrolase family 10  33.01 
 
 		 482 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2105  xylanase  31.07 
 
 		 674 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0988  glycoside hydrolase family 10  27.55 
 
 		 975 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.661558  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2392  Fibronectin type III domain protein  27.79 
 
 		 831 aa  172  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2391  Fibronectin type III domain protein  29.07 
 
 		 748 aa  169  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.999424  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  29.29 
 
 		 639 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3704  glycoside hydrolase family protein  32.3 
 
 		 417 aa  160  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2370  glycosy hydrolase family protein  27.38 
 
 		 457 aa  151  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249901  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2119  glycoside hydrolase family protein  28.16 
 
 		 760 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3662  glycoside hydrolase family protein  27.97 
 
 		 451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132636  normal  0.859273 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2369  glycosy hydrolase family protein  25.87 
 
 		 1014 aa  113  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  26.39 
 
 		 477 aa  97.8  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1433  glycoside hydrolase family 10  24.66 
 
 		 433 aa  92.4  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.43821  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  25.24 
 
 		 486 aa  88.6  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  26.67 
 
 		 820 aa  88.2  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2724  glycoside hydrolase family 10  21.52 
 
 		 408 aa  88.2  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.85294  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  27.24 
 
 		 347 aa  87.4  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  23.97 
 
 		 423 aa  87.4  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  26.67 
 
 		 756 aa  87.4  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  26.91 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  26 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  23.84 
 
 		 543 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  24.31 
 
 		 490 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20470  beta-1,4-xylanase  25.19 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01610  beta-1,4-xylanase  25.3 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0153  glycoside hydrolase family 10  21.79 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  24.75 
 
 		 474 aa  77.8  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  24.75 
 
 		 488 aa  77.8  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  25.19 
 
 		 829 aa  77  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  23.91 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2048  glycoside hydrolase family 10  24.46 
 
 		 433 aa  76.3  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.900928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  25.62 
 
 		 541 aa  76.6  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  25.96 
 
 		 457 aa  76.3  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  22.67 
 
 		 491 aa  75.5  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0181  Beta-1 4-xylanase-like  24.09 
 
 		 574 aa  75.5  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  23.13 
 
 		 678 aa  75.1  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  26.53 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  24.48 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  23.11 
 
 		 357 aa  74.7  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  23.45 
 
 		 472 aa  74.7  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  24.22 
 
 		 778 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  24.92 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  24.09 
 
 		 487 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  24.69 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  20.7 
 
 		 837 aa  73.6  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  25.34 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  26.13 
 
 		 912 aa  72.4  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  23.31 
 
 		 451 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  26.46 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  25.26 
 
 		 497 aa  70.1  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  27.3 
 
 		 1019 aa  69.7  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  22.62 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  22.78 
 
 		 474 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  23 
 
 		 1001 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  25.48 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0012  glycoside hydrolase family 10  24.43 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.577284 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  25.44 
 
 		 503 aa  68.2  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  26.33 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  23.79 
 
 		 454 aa  67  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  21.9 
 
 		 465 aa  66.6  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  25.96 
 
 		 451 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  25 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  21.26 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  23.88 
 
 		 495 aa  64.7  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  21.52 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  21.32 
 
 		 1050 aa  64.3  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  24.09 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  23.55 
 
 		 815 aa  64.3  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  25.81 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  24.49 
 
 		 457 aa  63.9  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  24.75 
 
 		 721 aa  63.9  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  23.7 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3590  glycoside hydrolase family protein  26.37 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.013688  hitchhiker  0.00813315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  23.23 
 
 		 324 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  23.08 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  23.75 
 
 		 628 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  21.49 
 
 		 1495 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  21.77 
 
 		 1041 aa  61.6  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  24.41 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  23.23 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  25.18 
 
 		 1247 aa  60.1  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  21.59 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  22.52 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  24.07 
 
 		 690 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  24.03 
 
 		 1146 aa  59.3  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  22.51 
 
 		 1018 aa  58.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  23.89 
 
 		 1037 aa  57.4  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  25.74 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  24.83 
 
 		 368 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  23.49 
 
 		 331 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  22.19 
 
 		 619 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  22.37 
 
 		 1186 aa  55.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  19.21 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  22.66 
 
 		 1059 aa  55.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  22.66 
 
 		 1059 aa  55.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  21.71 
 
 		 689 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>