130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3209 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3209  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
606 aa  1236    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.818517  normal  0.245162 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0323  TonB-like  42.62 
 
 
670 aa  438  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000416946  normal  0.597274 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0896  glycoside hydrolase family 10  38.29 
 
 
434 aa  244  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1074  glycoside hydrolase family 10  37.28 
 
 
498 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2172  glycoside hydrolase family 10  32.86 
 
 
482 aa  196  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2105  xylanase  34.45 
 
 
674 aa  192  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0988  glycoside hydrolase family 10  26.5 
 
 
975 aa  188  3e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.661558  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3704  glycoside hydrolase family protein  31.03 
 
 
417 aa  177  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  31.1 
 
 
639 aa  170  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2392  Fibronectin type III domain protein  28.74 
 
 
831 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2391  Fibronectin type III domain protein  30.69 
 
 
748 aa  161  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.999424  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2119  glycoside hydrolase family protein  31.84 
 
 
760 aa  155  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2370  glycosy hydrolase family protein  27.75 
 
 
457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249901  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3662  glycoside hydrolase family protein  30.83 
 
 
451 aa  141  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132636  normal  0.859273 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2369  glycosy hydrolase family protein  27.87 
 
 
1014 aa  131  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  31.38 
 
 
490 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  29.15 
 
 
383 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0181  Beta-1 4-xylanase-like  27.59 
 
 
574 aa  101  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  26.81 
 
 
398 aa  95.1  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  26.48 
 
 
347 aa  95.5  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01610  beta-1,4-xylanase  25.41 
 
 
415 aa  95.1  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  26.48 
 
 
347 aa  94  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  26.27 
 
 
371 aa  94  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  28.45 
 
 
487 aa  94  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  25.9 
 
 
541 aa  93.6  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  25.94 
 
 
399 aa  92  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  26.97 
 
 
457 aa  89  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  26.2 
 
 
423 aa  88.2  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  26.9 
 
 
394 aa  87.4  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  26.43 
 
 
678 aa  87  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  26.92 
 
 
465 aa  86.7  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2724  glycoside hydrolase family 10  25.06 
 
 
408 aa  87  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.85294  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  25.79 
 
 
389 aa  85.9  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  24.14 
 
 
837 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  27.05 
 
 
778 aa  85.5  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  26.85 
 
 
491 aa  84.3  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  27.24 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1433  glycoside hydrolase family 10  26.26 
 
 
433 aa  83.2  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.43821  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  25.52 
 
 
375 aa  83.2  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  26.92 
 
 
477 aa  82  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  26.59 
 
 
357 aa  81.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  29.65 
 
 
474 aa  81.6  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  25.16 
 
 
689 aa  80.9  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  25.17 
 
 
333 aa  80.1  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  26.52 
 
 
376 aa  79.3  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  24.38 
 
 
820 aa  79  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  26.88 
 
 
497 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20470  beta-1,4-xylanase  25.58 
 
 
399 aa  79.3  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  24.5 
 
 
756 aa  79  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  25.56 
 
 
454 aa  78.2  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  26.86 
 
 
1247 aa  77  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  25.17 
 
 
488 aa  76.3  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  23.81 
 
 
1041 aa  75.5  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  27.27 
 
 
337 aa  76.3  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  29.66 
 
 
324 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  25.54 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  25.72 
 
 
1186 aa  75.1  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  25.98 
 
 
370 aa  75.1  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  24.25 
 
 
472 aa  73.6  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  26.91 
 
 
1414 aa  72.8  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  24.9 
 
 
370 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  24.1 
 
 
1037 aa  72.8  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  27.05 
 
 
457 aa  72.8  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  23.23 
 
 
503 aa  72.4  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  24.29 
 
 
357 aa  71.2  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2048  glycoside hydrolase family 10  25.3 
 
 
433 aa  70.9  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.900928  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  27.11 
 
 
486 aa  70.5  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  24.07 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  24.13 
 
 
829 aa  70.1  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2962  glycoside hydrolase family 10  25.41 
 
 
357 aa  70.1  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0820888  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  26.3 
 
 
370 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  26.94 
 
 
1018 aa  69.3  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  24.32 
 
 
474 aa  69.3  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  24.03 
 
 
495 aa  68.6  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  22.88 
 
 
628 aa  68.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  27.48 
 
 
721 aa  68.6  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  22.89 
 
 
1478 aa  68.6  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0012  glycoside hydrolase family 10  23.44 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.577284 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  23.18 
 
 
366 aa  68.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  27.63 
 
 
1019 aa  68.2  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  26.11 
 
 
338 aa  68.2  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.05 
 
 
697 aa  67.8  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  28.06 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  24.5 
 
 
1001 aa  67  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  25.18 
 
 
323 aa  66.6  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  24.74 
 
 
451 aa  66.6  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  25.26 
 
 
543 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  26.9 
 
 
451 aa  65.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  24.21 
 
 
401 aa  64.7  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  22.41 
 
 
815 aa  63.9  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  25.09 
 
 
463 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  23.49 
 
 
359 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  23.36 
 
 
364 aa  62  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  24.92 
 
 
373 aa  61.2  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  25.56 
 
 
690 aa  61.2  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  24.77 
 
 
1495 aa  61.2  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  24.75 
 
 
328 aa  61.2  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2253  glycoside hydrolase family 10  25.73 
 
 
381 aa  61.2  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1373  glycoside hydrolase family protein  22.9 
 
 
382 aa  60.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0283938 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  22.87 
 
 
619 aa  59.7  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>