295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1239 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  100 
 
 
1414 aa  2855    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  72.83 
 
 
1247 aa  671    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  57.68 
 
 
1585 aa  342  2e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1418  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  59.02 
 
 
284 aa  329  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0892539  normal  0.540193 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  44.4 
 
 
1657 aa  315  4.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3878  putative esterase  56.25 
 
 
560 aa  302  4e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  44.65 
 
 
991 aa  262  3e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  44.36 
 
 
1266 aa  251  8e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  38.58 
 
 
541 aa  224  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  51.29 
 
 
1748 aa  219  4e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0181  Beta-1 4-xylanase-like  38.68 
 
 
574 aa  218  5.9999999999999996e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2390  Carbohydrate-binding family V/XII  42.64 
 
 
523 aa  217  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.254143  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  36.59 
 
 
1186 aa  217  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  39.11 
 
 
1288 aa  212  4e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  55.78 
 
 
1275 aa  205  5e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  52.8 
 
 
1160 aa  200  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  48.11 
 
 
1474 aa  196  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  47.8 
 
 
1217 aa  189  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  32.24 
 
 
997 aa  183  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3590  glycoside hydrolase family protein  32.21 
 
 
325 aa  181  9e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.013688  hitchhiker  0.00813315 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  31.51 
 
 
721 aa  181  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  37.25 
 
 
1295 aa  178  6e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  33.71 
 
 
3793 aa  178  8e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03861  glycosyl hydrolase family 10  32.44 
 
 
325 aa  171  6e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260596  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  40.73 
 
 
815 aa  171  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  35.25 
 
 
780 aa  154  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  42.42 
 
 
1002 aa  150  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  53.95 
 
 
1108 aa  149  5e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  39.94 
 
 
2270 aa  127  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03863  glycosyl hydrolase family 10  28.28 
 
 
271 aa  126  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  29.43 
 
 
423 aa  115  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  32.24 
 
 
2713 aa  115  7.000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  70 
 
 
1362 aa  114  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  28.72 
 
 
989 aa  110  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  31.93 
 
 
1068 aa  108  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  61.62 
 
 
1152 aa  108  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  28.81 
 
 
820 aa  107  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2555  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  29.06 
 
 
264 aa  105  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880484  normal  0.133865 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  28.87 
 
 
497 aa  102  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  27.21 
 
 
543 aa  101  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  27.86 
 
 
639 aa  101  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2105  xylanase  27.83 
 
 
674 aa  99.8  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  26.16 
 
 
678 aa  99.4  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  26.71 
 
 
333 aa  98.2  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  40.34 
 
 
1406 aa  97.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  27.91 
 
 
474 aa  96.7  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  28.02 
 
 
806 aa  96.3  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3802  protease  50.46 
 
 
778 aa  95.5  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.239343 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  27.18 
 
 
488 aa  94.4  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  28.04 
 
 
491 aa  93.6  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  29.51 
 
 
822 aa  93.6  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  25.99 
 
 
487 aa  93.6  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  32.67 
 
 
1547 aa  93.2  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  25.31 
 
 
837 aa  93.2  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  28.52 
 
 
457 aa  92.4  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  55.21 
 
 
915 aa  92  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  28.52 
 
 
756 aa  92  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  27.4 
 
 
815 aa  92  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  27.12 
 
 
457 aa  90.5  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2119  glycoside hydrolase family protein  26.09 
 
 
760 aa  90.5  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  25.85 
 
 
490 aa  89  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  47.37 
 
 
1132 aa  89.4  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  30.64 
 
 
2278 aa  89  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5393  hypothetical protein  35.56 
 
 
1303 aa  89  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56459  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  54.84 
 
 
703 aa  88.6  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  34.34 
 
 
1329 aa  87.8  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  25.99 
 
 
347 aa  88.2  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  24.7 
 
 
1018 aa  86.7  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  25.63 
 
 
347 aa  87  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  27.9 
 
 
912 aa  87  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  25.86 
 
 
1001 aa  85.9  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35.81 
 
 
984 aa  84.3  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  26.64 
 
 
472 aa  83.2  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3849  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  25.68 
 
 
276 aa  82.8  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  26.4 
 
 
357 aa  82.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  36.4 
 
 
1228 aa  82.4  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  26.2 
 
 
1019 aa  80.9  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  25.5 
 
 
474 aa  80.5  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  44.32 
 
 
1123 aa  80.5  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  25.73 
 
 
477 aa  80.5  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  24.32 
 
 
495 aa  80.5  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  50.56 
 
 
1059 aa  80.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  23.91 
 
 
778 aa  80.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  25.25 
 
 
690 aa  79.7  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  34.62 
 
 
641 aa  79.7  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  25.09 
 
 
1059 aa  79.3  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  27.05 
 
 
451 aa  79.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  25.09 
 
 
1059 aa  79.3  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  47.19 
 
 
587 aa  79.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  55.68 
 
 
979 aa  79  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  27.18 
 
 
1050 aa  78.6  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  42.86 
 
 
1285 aa  78.6  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3209  glycoside hydrolase family protein  27.08 
 
 
606 aa  79  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.818517  normal  0.245162 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  35.92 
 
 
642 aa  78.6  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  24.74 
 
 
1037 aa  77.8  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  27.66 
 
 
5453 aa  77.8  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  24.81 
 
 
829 aa  78.2  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  26.07 
 
 
309 aa  77.8  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  45.56 
 
 
846 aa  76.6  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  25.34 
 
 
1020 aa  76.6  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>