150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2528 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  100 
 
 		 2270 aa  4428    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  40.03 
 
 		 3793 aa  949    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  32.14 
 
 		 1547 aa  389  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  29.84 
 
 		 1980 aa  302  5e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  38.53 
 
 		 1068 aa  288  8e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  27.48 
 
 		 2402 aa  286  3.0000000000000004e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  32.11 
 
 		 3324 aa  252  5e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  31.5 
 
 		 989 aa  208  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  31.99 
 
 		 1329 aa  189  7e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1934  hypothetical protein  31.64 
 
 		 1067 aa  187  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  30.28 
 
 		 2713 aa  173  3e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  39.44 
 
 		 991 aa  166  7e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  39.18 
 
 		 1108 aa  158  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  36.46 
 
 		 1266 aa  155  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  37.04 
 
 		 1288 aa  152  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  35.31 
 
 		 1247 aa  151  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  33.33 
 
 		 1657 aa  147  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  27.28 
 
 		 2278 aa  147  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  29.17 
 
 		 2262 aa  135  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  27.06 
 
 		 4429 aa  133  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  32.06 
 
 		 1748 aa  129  9e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  30.98 
 
 		 2833 aa  123  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  28.94 
 
 		 4071 aa  121  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  26.65 
 
 		 1287 aa  120  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  27.28 
 
 		 3542 aa  118  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  25.1 
 
 		 3737 aa  117  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  35.66 
 
 		 1585 aa  116  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  35.66 
 
 		 1217 aa  115  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  25.29 
 
 		 6497 aa  111  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  33.1 
 
 		 1474 aa  108  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  37.02 
 
 		 1160 aa  102  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  38.1 
 
 		 1414 aa  97.8  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2774  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1804 aa  96.7  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.496989  hitchhiker  0.00218056 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  26.89 
 
 		 1969 aa  90.5  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1064 aa  90.1  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  27.17 
 
 		 5453 aa  87.4  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  33.91 
 
 		 5544 aa  82.8  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  35.63 
 
 		 1295 aa  82.4  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  32.64 
 
 		 1002 aa  82  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1228 aa  79.3  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  35.71 
 
 		 3471 aa  77.8  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2778  hypothetical protein  30.09 
 
 		 657 aa  78.2  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.314072 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2780  hypothetical protein  30.09 
 
 		 648 aa  78.2  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167113  normal  0.164287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  36.51 
 
 		 3927 aa  76.6  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  26.91 
 
 		 1313 aa  76.6  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  26.83 
 
 		 1222 aa  76.3  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  39.56 
 
 		 1483 aa  76.3  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  28.35 
 
 		 2411 aa  75.9  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1976 aa  75.5  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  28.35 
 
 		 2367 aa  74.3  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  34.07 
 
 		 4896 aa  74.7  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  40.45 
 
 		 2377 aa  74.7  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  36.44 
 
 		 599 aa  73.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  23.8 
 
 		 1245 aa  73.9  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  31.97 
 
 		 3602 aa  73.2  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4308  Fibronectin type III domain protein  25.34 
 
 		 1377 aa  73.6  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0936224  hitchhiker  0.00620072 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  25.86 
 
 		 1345 aa  73.2  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  22.36 
 
 		 815 aa  72.8  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  24.25 
 
 		 792 aa  71.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  25.27 
 
 		 541 aa  70.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1488 aa  70.1  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  31.25 
 
 		 1275 aa  69.3  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  30.86 
 
 		 711 aa  68.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  24.01 
 
 		 1389 aa  68.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  28.76 
 
 		 822 aa  67.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  32.06 
 
 		 3227 aa  66.6  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  24.98 
 
 		 2421 aa  66.2  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1799  hypothetical protein  31.02 
 
 		 742 aa  65.9  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  32.03 
 
 		 2478 aa  63.9  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  29.51 
 
 		 1602 aa  63.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  26.29 
 
 		 886 aa  63.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  26.62 
 
 		 874 aa  63.2  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  26.65 
 
 		 561 aa  62.8  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  23.78 
 
 		 1059 aa  62.4  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  26.14 
 
 		 2454 aa  62.4  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  27.9 
 
 		 496 aa  62.4  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  38.89 
 
 		 315 aa  62  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  35.58 
 
 		 815 aa  61.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  38.71 
 
 		 1259 aa  61.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  35.16 
 
 		 581 aa  60.8  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0530  hypothetical protein  35.59 
 
 		 1210 aa  60.8  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0010082  normal  0.0887655 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0841  hypothetical protein  28.12 
 
 		 2416 aa  60.8  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  25.96 
 
 		 1606 aa  60.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  27.11 
 
 		 2807 aa  60.5  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  30.43 
 
 		 726 aa  60.1  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  27.04 
 
 		 938 aa  59.7  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  25.07 
 
 		 5442 aa  59.3  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  32.71 
 
 		 2772 aa  59.3  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  28.1 
 
 		 1152 aa  58.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  27.05 
 
 		 1620 aa  58.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  28.57 
 
 		 2927 aa  58.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  24.39 
 
 		 1371 aa  58.9  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  32.5 
 
 		 490 aa  57.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2517  hypothetical protein  40.91 
 
 		 615 aa  57.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.174672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  26.21 
 
 		 799 aa  58.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  24.36 
 
 		 7919 aa  57.4  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  25 
 
 		 1466 aa  57.4  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  29.59 
 
 		 775 aa  57.4  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  30.91 
 
 		 750 aa  56.6  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  28.05 
 
 		 890 aa  56.2  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>