59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4115 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5393  hypothetical protein  43.11 
 
 		 1303 aa  728    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  100 
 
 		 2278 aa  4398    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4205  hypothetical protein  37.58 
 
 		 1386 aa  590  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  29.3 
 
 		 3737 aa  240  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  29.4 
 
 		 3793 aa  223  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  28.69 
 
 		 4429 aa  209  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  37.36 
 
 		 1748 aa  188  9e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  27.5 
 
 		 2005 aa  187  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  33.13 
 
 		 1228 aa  177  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  35.64 
 
 		 1160 aa  162  5e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  27.68 
 
 		 2270 aa  155  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2477  hypothetical protein  30.03 
 
 		 1414 aa  130  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3498  hypothetical protein  31.71 
 
 		 1440 aa  125  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.309515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1764  hypothetical protein  28.44 
 
 		 1079 aa  123  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00516909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  39.18 
 
 		 1302 aa  117  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  25.45 
 
 		 3542 aa  117  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4548  hypothetical protein  28.8 
 
 		 659 aa  114  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546791  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  46.41 
 
 		 1275 aa  113  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  29.87 
 
 		 1108 aa  98.2  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3440  hypothetical protein  26.74 
 
 		 1439 aa  96.7  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  25.2 
 
 		 3324 aa  92  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  27.12 
 
 		 1657 aa  87.8  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0490  hypothetical protein  33.87 
 
 		 691 aa  86.3  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.79487  normal  0.17216 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  26.37 
 
 		 2713 aa  78.2  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0042  metallophosphoesterase  28.64 
 
 		 774 aa  77.4  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0825488 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  26.08 
 
 		 991 aa  75.9  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1765  hypothetical protein  31.94 
 
 		 349 aa  73.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  31.58 
 
 		 1414 aa  67.4  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  28.43 
 
 		 1266 aa  67.4  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  24.71 
 
 		 1313 aa  66.2  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  25.19 
 
 		 1068 aa  65.9  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  26.22 
 
 		 1547 aa  65.1  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  27.62 
 
 		 1288 aa  63.9  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  25.47 
 
 		 5453 aa  63.9  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  29.89 
 
 		 2267 aa  62.4  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  31.75 
 
 		 4896 aa  61.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  28.71 
 
 		 1750 aa  61.6  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2870  hypothetical protein  28.42 
 
 		 1243 aa  60.5  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.772535  hitchhiker  0.00123304 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  27.47 
 
 		 989 aa  60.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  25.42 
 
 		 5544 aa  59.3  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  24.01 
 
 		 1329 aa  58.9  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  35.04 
 
 		 726 aa  55.8  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  46.75 
 
 		 1679 aa  55.8  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  34.43 
 
 		 1247 aa  51.2  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  24.87 
 
 		 6497 aa  52  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  27.76 
 
 		 1217 aa  50.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  29.2 
 
 		 1474 aa  49.7  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  27.27 
 
 		 1585 aa  49.7  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  30.09 
 
 		 1602 aa  49.7  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0835  hypothetical protein  29.8 
 
 		 1084 aa  49.3  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  29.44 
 
 		 652 aa  48.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  26.39 
 
 		 1389 aa  49.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1027  hypothetical protein  23.73 
 
 		 1525 aa  48.9  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.275206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4308  Fibronectin type III domain protein  26.91 
 
 		 1377 aa  48.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0936224  hitchhiker  0.00620072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4722  Immunoglobulin V-set domain protein  33.09 
 
 		 994 aa  47.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.933088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  26.03 
 
 		 871 aa  47  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  28.24 
 
 		 711 aa  46.6  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  24.03 
 
 		 1259 aa  46.6  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  26.06 
 
 		 650 aa  45.8  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>