More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1221 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  100 
 
 
1657 aa  3357    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  45.93 
 
 
1108 aa  353  1e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  36.33 
 
 
972 aa  352  4e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  34.85 
 
 
1132 aa  348  4e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  45.67 
 
 
1288 aa  342  4e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  35.12 
 
 
1029 aa  323  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  40.84 
 
 
1266 aa  311  5e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  40.12 
 
 
991 aa  298  9e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  43.28 
 
 
1414 aa  282  4e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  36.69 
 
 
3793 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  31.36 
 
 
999 aa  236  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  31.36 
 
 
999 aa  233  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  31.36 
 
 
999 aa  233  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  31.37 
 
 
2713 aa  208  6e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  29.76 
 
 
712 aa  204  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  32.18 
 
 
1329 aa  202  3.9999999999999996e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  38.71 
 
 
342 aa  201  7.999999999999999e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  29.62 
 
 
841 aa  198  8.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  36.61 
 
 
585 aa  193  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3694  hypothetical protein  42.97 
 
 
275 aa  190  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03943  hypothetical protein  43.89 
 
 
253 aa  189  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3715  hypothetical protein  39.59 
 
 
259 aa  188  8e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.937408  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  37.47 
 
 
1247 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  32.98 
 
 
1547 aa  171  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3388  hypothetical protein  41.2 
 
 
245 aa  166  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  36.1 
 
 
1585 aa  165  6e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  36.34 
 
 
1217 aa  164  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  35.37 
 
 
1474 aa  163  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.88 
 
 
450 aa  160  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  33.12 
 
 
1748 aa  159  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3136  hypothetical protein  41.28 
 
 
244 aa  159  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.030981  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.33 
 
 
451 aa  154  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.42 
 
 
427 aa  152  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.83 
 
 
442 aa  151  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  43.46 
 
 
815 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  29.23 
 
 
908 aa  150  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  33.94 
 
 
2270 aa  150  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.1 
 
 
455 aa  149  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  36.66 
 
 
1275 aa  148  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.43 
 
 
396 aa  145  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  25.81 
 
 
1200 aa  145  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.05 
 
 
367 aa  144  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  35.76 
 
 
461 aa  144  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  25.7 
 
 
1505 aa  143  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  25.82 
 
 
1151 aa  140  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  24.83 
 
 
941 aa  140  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2666  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.97 
 
 
388 aa  139  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000177131  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  23.57 
 
 
892 aa  135  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  34.98 
 
 
371 aa  135  9e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1937  carbohydrate-binding family 6 protein  38.17 
 
 
263 aa  134  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.33 
 
 
403 aa  133  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  31.53 
 
 
422 aa  132  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  34.53 
 
 
1160 aa  131  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.77 
 
 
460 aa  128  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.01 
 
 
414 aa  128  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  32.19 
 
 
408 aa  126  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  23.88 
 
 
1142 aa  126  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0989  hypothetical protein  32.79 
 
 
475 aa  125  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  34.02 
 
 
374 aa  125  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  33.2 
 
 
374 aa  125  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.58 
 
 
387 aa  124  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  24.16 
 
 
1182 aa  124  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  32.75 
 
 
384 aa  124  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.09 
 
 
570 aa  124  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  33.77 
 
 
370 aa  124  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1569  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.65 
 
 
388 aa  124  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  32.77 
 
 
392 aa  122  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  25.09 
 
 
1138 aa  121  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2694  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40 
 
 
520 aa  120  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439378  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  34.4 
 
 
1002 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  34.12 
 
 
419 aa  120  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  32.75 
 
 
382 aa  120  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  32.46 
 
 
394 aa  119  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  29.52 
 
 
399 aa  119  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.77 
 
 
392 aa  119  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  34.62 
 
 
343 aa  119  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  33.46 
 
 
388 aa  119  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  33.85 
 
 
792 aa  118  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  31.86 
 
 
399 aa  118  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  30.93 
 
 
4429 aa  118  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  31.36 
 
 
369 aa  117  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1224  glucose sorbosone dehydrogenase  34.55 
 
 
465 aa  118  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  33.65 
 
 
394 aa  117  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  33.77 
 
 
369 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  31.06 
 
 
381 aa  117  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4315  glucose sorbosone dehydrogenase  30.94 
 
 
406 aa  117  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.748634 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  35.62 
 
 
365 aa  116  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  28.83 
 
 
367 aa  116  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  30.06 
 
 
388 aa  115  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.33 
 
 
809 aa  115  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.43 
 
 
407 aa  115  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  35.51 
 
 
400 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  24.26 
 
 
918 aa  114  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  34.51 
 
 
388 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  31.44 
 
 
369 aa  114  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  32.59 
 
 
794 aa  113  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.46 
 
 
729 aa  113  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  32.57 
 
 
405 aa  112  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  30.26 
 
 
381 aa  112  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  28.54 
 
 
1750 aa  112  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>