157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0597 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  100 
 
 		 1547 aa  3005    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  32.29 
 
 		 2270 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  33.84 
 
 		 2402 aa  350  9e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  35.91 
 
 		 3793 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  28.07 
 
 		 2713 aa  207  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  33.4 
 
 		 1657 aa  170  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  31.09 
 
 		 1068 aa  167  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  27.87 
 
 		 1329 aa  160  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  27.71 
 
 		 1064 aa  157  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  30.26 
 
 		 2262 aa  154  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  35.82 
 
 		 1288 aa  151  8e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  34.08 
 
 		 1108 aa  149  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  32.41 
 
 		 989 aa  148  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  33.42 
 
 		 4071 aa  146  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  26.44 
 
 		 561 aa  134  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  32.74 
 
 		 2833 aa  124  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  33.85 
 
 		 1247 aa  122  7.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  34.05 
 
 		 1266 aa  121  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  33.93 
 
 		 991 aa  118  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  30.15 
 
 		 532 aa  105  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  25.18 
 
 		 1059 aa  105  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  24.1 
 
 		 1313 aa  104  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  30.32 
 
 		 815 aa  104  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  23.96 
 
 		 1222 aa  103  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  27.5 
 
 		 3324 aa  101  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2774  hypothetical protein  24.72 
 
 		 1804 aa  99  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.496989  hitchhiker  0.00218056 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  26.11 
 
 		 6497 aa  96.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  27.08 
 
 		 503 aa  95.1  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  27.17 
 
 		 535 aa  92.4  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  51.09 
 
 		 599 aa  92  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  22.1 
 
 		 540 aa  92  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2778  hypothetical protein  27.42 
 
 		 657 aa  90.5  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.314072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  24.6 
 
 		 822 aa  90.1  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2780  hypothetical protein  27.74 
 
 		 648 aa  89.7  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167113  normal  0.164287 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  29.96 
 
 		 1748 aa  89.4  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  26.01 
 
 		 1483 aa  89.4  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  23.95 
 
 		 726 aa  88.6  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  29.36 
 
 		 2367 aa  87.4  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  29.22 
 
 		 2421 aa  87.4  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  27.12 
 
 		 5453 aa  87.4  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  29.36 
 
 		 2411 aa  87.4  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  31.7 
 
 		 1474 aa  86.7  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  32.19 
 
 		 2772 aa  85.9  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  25.47 
 
 		 1345 aa  85.5  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  29.22 
 
 		 2454 aa  85.5  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1980 aa  84.7  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  30.39 
 
 		 1585 aa  83.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  29.36 
 
 		 2807 aa  83.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  28.02 
 
 		 1160 aa  82.8  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  30.39 
 
 		 1217 aa  82.8  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  36.26 
 
 		 1259 aa  82.4  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1287 aa  82  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  34.78 
 
 		 3602 aa  82  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  30.31 
 
 		 5298 aa  81.6  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  32.43 
 
 		 750 aa  80.5  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  28.61 
 
 		 890 aa  81.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  25.36 
 
 		 496 aa  79.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  25.08 
 
 		 534 aa  79  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  36.36 
 
 		 4896 aa  77.8  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  32.18 
 
 		 1526 aa  77  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  27.58 
 
 		 1463 aa  77  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  25.85 
 
 		 874 aa  76.3  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  25.16 
 
 		 1488 aa  75.5  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  31.48 
 
 		 2296 aa  75.5  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  23.78 
 
 		 627 aa  75.5  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  26.07 
 
 		 2278 aa  73.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  36.9 
 
 		 2005 aa  72.8  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  23.83 
 
 		 1193 aa  72.4  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  32.35 
 
 		 3227 aa  72  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  28.43 
 
 		 799 aa  72  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  30.55 
 
 		 1002 aa  71.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  31.54 
 
 		 3471 aa  71.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  24.67 
 
 		 1245 aa  70.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  33.96 
 
 		 711 aa  71.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  27.06 
 
 		 885 aa  71.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  37.33 
 
 		 2377 aa  70.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  32.54 
 
 		 1414 aa  70.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  26.36 
 
 		 938 aa  70.1  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2040  hypothetical protein  33.04 
 
 		 2022 aa  70.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0726199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  27.31 
 
 		 3737 aa  70.1  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  25.7 
 
 		 792 aa  69.3  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2852  hypothetical protein  29.86 
 
 		 759 aa  69.3  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536635  normal  0.285304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  27.9 
 
 		 1602 aa  68.6  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  37.5 
 
 		 3191 aa  68.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  35.63 
 
 		 1066 aa  68.6  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4308  Fibronectin type III domain protein  25.35 
 
 		 1377 aa  67.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0936224  hitchhiker  0.00620072 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  41.11 
 
 		 315 aa  67.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  31.87 
 
 		 1371 aa  67.8  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  37.84 
 
 		 3927 aa  66.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  25.45 
 
 		 1389 aa  67  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  41.46 
 
 		 1665 aa  66.2  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  36.25 
 
 		 2588 aa  65.5  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  27.36 
 
 		 1275 aa  65.5  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  32.58 
 
 		 4013 aa  64.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.44 
 
 		 1679 aa  64.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0531  hypothetical protein  40.28 
 
 		 1032 aa  64.3  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  32.31 
 
 		 871 aa  63.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  26.46 
 
 		 774 aa  62.4  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  35.92 
 
 		 676 aa  62.4  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  25.53 
 
 		 5544 aa  62.4  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>