75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1269 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  100 
 
 
874 aa  1758    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  29.94 
 
 
2402 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  28.28 
 
 
2262 aa  181  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  26.62 
 
 
6497 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2774  hypothetical protein  28.61 
 
 
1804 aa  178  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.496989  hitchhiker  0.00218056 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  25.41 
 
 
5298 aa  141  4.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2852  hypothetical protein  25.91 
 
 
759 aa  134  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536635  normal  0.285304 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  29.76 
 
 
1064 aa  129  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  27.33 
 
 
561 aa  119  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  25.4 
 
 
2713 aa  99  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  27.95 
 
 
1463 aa  97.8  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.64 
 
 
1679 aa  97.4  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  29.06 
 
 
885 aa  87.4  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  26.65 
 
 
534 aa  86.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  25 
 
 
890 aa  82.8  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  23.92 
 
 
5544 aa  77.4  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  24.26 
 
 
3793 aa  76.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  30.19 
 
 
1547 aa  75.5  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1336  Hyalin  25.06 
 
 
4044 aa  71.6  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  29.56 
 
 
532 aa  69.3  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  26.69 
 
 
2270 aa  69.3  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09243  hypothetical protein  35.71 
 
 
1031 aa  67.4  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.100624  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  29.17 
 
 
540 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3916  hypothetical protein  21.56 
 
 
967 aa  65.1  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0844847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  26.91 
 
 
503 aa  65.1  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03265  hypothetical protein  38.71 
 
 
528 aa  64.7  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0507671  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  31.69 
 
 
774 aa  64.3  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  31.46 
 
 
535 aa  63.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  27.02 
 
 
1657 aa  62.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  32.38 
 
 
669 aa  60.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  26.24 
 
 
3324 aa  60.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  24.58 
 
 
1222 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12818  hypothetical protein  36.96 
 
 
192 aa  58.2  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.562782  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1456  hypothetical protein  33.78 
 
 
1024 aa  57.8  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00611896  normal  0.0757666 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  21.88 
 
 
1329 aa  57.8  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2150  hypothetical protein  36.14 
 
 
356 aa  57.4  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  28.57 
 
 
1483 aa  57  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  33.9 
 
 
2005 aa  55.8  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  21.46 
 
 
1160 aa  55.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  25.3 
 
 
1266 aa  53.9  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  22.54 
 
 
1748 aa  53.5  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  31.08 
 
 
726 aa  52.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10308  putative secreted ribonuclease  33.33 
 
 
365 aa  52.8  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1525  Rhs family-like protein  36.56 
 
 
3794 aa  52  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.14033 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  31.33 
 
 
3958 aa  52  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  45.59 
 
 
662 aa  51.6  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  23.01 
 
 
989 aa  51.2  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  31.94 
 
 
1437 aa  51.2  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  25.29 
 
 
1288 aa  50.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03245  hypothetical protein  34.04 
 
 
406 aa  50.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.487069  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01070  hypothetical protein  28.76 
 
 
1030 aa  49.7  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5393  hypothetical protein  25.69 
 
 
1303 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56459  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  26.2 
 
 
1163 aa  48.5  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  26.7 
 
 
822 aa  48.5  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  25.45 
 
 
693 aa  48.1  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3550  Dystroglycan-type cadherin domain protein  34.48 
 
 
962 aa  47.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05870  hypothetical protein  38.36 
 
 
243 aa  47.8  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0427  mannosidase-related protein  26.14 
 
 
2443 aa  47.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.37928  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05425  hypothetical protein  28.92 
 
 
316 aa  47  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246659  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1123  PKD domain-containing protein  52.78 
 
 
1097 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2870  hypothetical protein  32.23 
 
 
1243 aa  47.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.772535  hitchhiker  0.00123304 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  32.26 
 
 
2239 aa  46.6  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  31.76 
 
 
887 aa  46.2  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2477  hypothetical protein  27.14 
 
 
1414 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130692  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  23.24 
 
 
991 aa  45.8  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  24.8 
 
 
1139 aa  45.8  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  33.33 
 
 
461 aa  45.8  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  35.56 
 
 
465 aa  45.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09473  fat protein-possibly involved in cell-cell attachment  28.38 
 
 
1441 aa  45.1  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  22.01 
 
 
1068 aa  45.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  27.47 
 
 
613 aa  44.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2248  hypothetical protein  26.52 
 
 
549 aa  44.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03270  hypothetical protein  27.91 
 
 
1070 aa  44.7  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.88849  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  32.47 
 
 
1976 aa  44.7  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1018  thermopsin  28.14 
 
 
952 aa  44.3  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0978818 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>