17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01070 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_00775  iron-regulated protein FrpC  70.13 
 
 
2364 aa  970    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01070  hypothetical protein  100 
 
 
1030 aa  2062    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  36.31 
 
 
774 aa  251  5e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06075  hypothetical protein  33.7 
 
 
766 aa  227  8e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.903534  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01065  hypothetical protein  30.36 
 
 
860 aa  163  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1123  PKD domain-containing protein  28.95 
 
 
1097 aa  99.8  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03245  hypothetical protein  39.76 
 
 
406 aa  95.5  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.487069  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0174  hypothetical protein  30.77 
 
 
438 aa  92.8  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.023441  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4344  hypothetical protein  34.85 
 
 
321 aa  85.5  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0548812  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06065  hypothetical protein  30.08 
 
 
873 aa  82.4  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.615706  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  27.87 
 
 
676 aa  67.4  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0857  hypothetical protein  29.13 
 
 
1280 aa  58.2  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3000  hypothetical protein  29 
 
 
526 aa  55.8  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  37.84 
 
 
1657 aa  47  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  30.23 
 
 
1345 aa  47  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  29.59 
 
 
1222 aa  45.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  28.16 
 
 
3958 aa  45.1  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>