23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03245 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03245  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  792    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.487069  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00775  iron-regulated protein FrpC  35.65 
 
 		 2364 aa  106  7e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01070  hypothetical protein  40 
 
 		 1030 aa  99  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01065  hypothetical protein  32.69 
 
 		 860 aa  68.2  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2032  hypothetical protein  36.67 
 
 		 1908 aa  62.4  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  37.84 
 
 		 774 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  41.03 
 
 		 2074 aa  53.9  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09051  thermolysin  29.55 
 
 		 984 aa  52.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03270  hypothetical protein  34.83 
 
 		 1070 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.88849  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  33.33 
 
 		 887 aa  51.2  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  35.82 
 
 		 1264 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06065  hypothetical protein  38.36 
 
 		 873 aa  50.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.615706  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  28.74 
 
 		 1389 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1123  PKD domain-containing protein  27.46 
 
 		 1097 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.72 
 
 		 1679 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3440  hypothetical protein  30.95 
 
 		 1439 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  26.37 
 
 		 655 aa  45.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  35.23 
 
 		 874 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0638  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  34.19 
 
 		 1407 aa  45.8  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.652963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3106  hypothetical protein  28.38 
 
 		 595 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3103  hypothetical protein  28.38 
 
 		 588 aa  44.3  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09243  hypothetical protein  30.23 
 
 		 1031 aa  43.9  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.100624  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1456  hypothetical protein  19.28 
 
 		 1024 aa  42.7  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00611896  normal  0.0757666 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>