22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1456 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1456  hypothetical protein  100 
 
 		 1024 aa  2000    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00611896  normal  0.0757666 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0427  mannosidase-related protein  40.09 
 
 		 2443 aa  536  1e-151  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.37928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  36.26 
 
 		 739 aa  63.9  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09473  fat protein-possibly involved in cell-cell attachment  26.32 
 
 		 1441 aa  62  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03265  hypothetical protein  24.09 
 
 		 528 aa  61.2  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0507671  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1893  peptidase-like  23.38 
 
 		 2632 aa  57.4  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  33.78 
 
 		 874 aa  57.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4197  peptidase domain protein  27.74 
 
 		 1063 aa  55.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000751128  normal  0.547659 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  30.67 
 
 		 461 aa  55.1  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05870  hypothetical protein  37.78 
 
 		 243 aa  55.1  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  27.03 
 
 		 617 aa  54.3  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  24.05 
 
 		 1141 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0444  hypothetical protein  34.57 
 
 		 1394 aa  52.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3308  hypothetical protein  31.65 
 
 		 340 aa  51.6  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0626  hypothetical protein  32.47 
 
 		 288 aa  48.9  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.174931 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  32 
 
 		 614 aa  48.5  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01825  hypothetical protein  36.36 
 
 		 654 aa  48.1  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0922  hypothetical protein  33.8 
 
 		 730 aa  47.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0622402  normal  0.970472 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0902  hypothetical protein  30.56 
 
 		 545 aa  47  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.440975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  29.89 
 
 		 613 aa  45.8  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  28.77 
 
 		 601 aa  45.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5097  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  26.58 
 
 		 727 aa  45.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>