52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3106 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3103  hypothetical protein  92.62 
 
 		 588 aa  1104    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3106  hypothetical protein  100 
 
 		 595 aa  1215    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  27 
 
 		 339 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  24.93 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  25.41 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  25.9 
 
 		 795 aa  61.6  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  26.98 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  27.62 
 
 		 321 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  25.77 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  26.99 
 
 		 776 aa  58.2  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  29.46 
 
 		 990 aa  57.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3021  hypothetical protein  30.88 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  38.75 
 
 		 461 aa  56.6  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  23.25 
 
 		 430 aa  56.6  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  25.87 
 
 		 1557 aa  56.2  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  26.82 
 
 		 1762 aa  55.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  25.17 
 
 		 334 aa  54.3  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  27.73 
 
 		 445 aa  52  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  30.63 
 
 		 1035 aa  52.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 461 aa  51.6  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  26.69 
 
 		 717 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1764  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1079 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00516909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  31.33 
 
 		 695 aa  48.9  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09243  hypothetical protein  28.72 
 
 		 1031 aa  48.9  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.100624  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  25.91 
 
 		 471 aa  47.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.84 
 
 		 726 aa  47.4  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  24.92 
 
 		 497 aa  47.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15262  predicted protein  27.23 
 
 		 336 aa  47.4  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  27.69 
 
 		 693 aa  47.4  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  34.62 
 
 		 669 aa  46.6  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05870  hypothetical protein  25.64 
 
 		 243 aa  47  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13363  cell wall surface anchor family protein  30.68 
 
 		 416 aa  47  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.259442  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.55 
 
 		 1679 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  31.3 
 
 		 607 aa  46.6  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03245  hypothetical protein  26.74 
 
 		 406 aa  46.2  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.487069  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  25.29 
 
 		 2239 aa  46.2  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7153  predicted protein  30.3 
 
 		 180 aa  45.8  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.788569  normal  0.191003 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  28.25 
 
 		 812 aa  45.4  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0295  hypothetical protein  31.08 
 
 		 621 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0654  hypothetical protein  30 
 
 		 390 aa  44.7  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.179815 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  39.34 
 
 		 1437 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  26.11 
 
 		 2942 aa  44.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  32.69 
 
 		 2002 aa  45.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  29.79 
 
 		 887 aa  45.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1427  thiol protease/hemagglutinin PrtT precursor, putative  28.57 
 
 		 843 aa  44.7  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.491886 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1169  hypothetical protein  37.25 
 
 		 64 aa  44.3  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00514608  decreased coverage  0.00854955 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0427  mannosidase-related protein  28.41 
 
 		 2443 aa  43.9  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.37928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  27.34 
 
 		 2690 aa  43.9  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  37.14 
 
 		 558 aa  43.9  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3777  hypothetical protein  32.47 
 
 		 1163 aa  43.9  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  27.98 
 
 		 586 aa  43.5  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  23 
 
 		 1656 aa  43.5  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>