86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1666 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  100 
 
 
344 aa  700    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  63.1 
 
 
341 aa  448  1e-125  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  37.89 
 
 
312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  38.14 
 
 
317 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  35.81 
 
 
321 aa  186  7e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  35.26 
 
 
321 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  32 
 
 
1762 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  33.83 
 
 
339 aa  143  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  30.57 
 
 
334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  30.66 
 
 
326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  32.61 
 
 
993 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  30.74 
 
 
1557 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  32.19 
 
 
454 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  31.56 
 
 
373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  28.43 
 
 
445 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  30.25 
 
 
1656 aa  123  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  29.2 
 
 
776 aa  121  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  31.37 
 
 
990 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  29.31 
 
 
318 aa  116  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  31.88 
 
 
1017 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  28.08 
 
 
795 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  27.3 
 
 
508 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  31.52 
 
 
1009 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  31.52 
 
 
1009 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1741  kelch repeat-containing protein  26.1 
 
 
314 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.571519  normal  0.867228 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  28.01 
 
 
321 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  28.98 
 
 
471 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  27.68 
 
 
693 aa  94.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  28.46 
 
 
812 aa  94  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  36.6 
 
 
1514 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  27.92 
 
 
497 aa  89.7  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  28.03 
 
 
461 aa  89.4  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  27.85 
 
 
1461 aa  84.7  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  29.35 
 
 
430 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  26.46 
 
 
1407 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  27.14 
 
 
642 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  24.69 
 
 
717 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04564  Kelch-domain proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q703G6]  26.83 
 
 
1474 aa  72.4  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  28.25 
 
 
2942 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26 
 
 
1453 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7153  predicted protein  31.87 
 
 
180 aa  70.9  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.788569  normal  0.191003 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15262  predicted protein  27.6 
 
 
336 aa  67  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0169  kelch repeat-containing protein  47.83 
 
 
483 aa  67  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4136  kelch repeat-containing protein  26.28 
 
 
605 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378672  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2125  kelch repeat-containing protein  26.24 
 
 
484 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602938  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3106  hypothetical protein  25.41 
 
 
595 aa  63.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0305  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24 
 
 
1451 aa  63.2  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6820  predicted protein  28.41 
 
 
236 aa  63.2  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.148371  hitchhiker  0.00500772 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2580  Kelch repeat-containing protein  28.22 
 
 
557 aa  62.8  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  26.96 
 
 
450 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  23.08 
 
 
725 aa  62  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3103  hypothetical protein  24.83 
 
 
588 aa  61.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655604  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  25 
 
 
586 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  25.7 
 
 
366 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42834  predicted protein  26.75 
 
 
639 aa  60.8  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  25.32 
 
 
646 aa  60.1  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0037  Kelch repeat-containing protein  28.11 
 
 
346 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0861801  normal  0.239294 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0568  kelch repeat-containing protein  27.19 
 
 
396 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.558625  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9490  predicted protein  22.52 
 
 
506 aa  57.4  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368235  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0752  kelch repeat-containing protein  28.93 
 
 
368 aa  57  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02740  conserved hypothetical protein  27.03 
 
 
1556 aa  57  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52303  protein involved in cell fusion and morphogenesis  26.67 
 
 
970 aa  56.2  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248654  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2029  kelch repeat-containing protein  29.49 
 
 
514 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100771  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0025  kelch repeat-containing protein  22.79 
 
 
667 aa  54.7  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1953  kelch repeat-containing protein  24.7 
 
 
460 aa  53.9  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2624  Kelch repeat-containing protein  24.74 
 
 
372 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0288564  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6725  Kelch repeat-containing protein  24.58 
 
 
698 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1832  Kelch repeat protein  25.93 
 
 
448 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0801627  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3966  kelch domain-containing protein  24.31 
 
 
402 aa  50.8  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.422532  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0493  kelch repeat-containing protein  24.17 
 
 
376 aa  50.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80234  carboxymethyltransferase  24.22 
 
 
692 aa  48.9  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.363907 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1051  hypothetical protein  23.86 
 
 
311 aa  48.1  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00813  conserved kelch repeat protein TeaB (Eurofung)  24.3 
 
 
713 aa  46.6  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2467  cyclically-permuted mutatrotase family protein  23.86 
 
 
383 aa  46.2  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000354773  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37571  predicted protein  27.84 
 
 
174 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.481063  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 
850 aa  45.8  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  27.53 
 
 
377 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  28.99 
 
 
833 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_200  predicted protein  25.48 
 
 
923 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0238096 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4835  N-acetylneuraminic acid mutarotase  24.49 
 
 
368 aa  44.3  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4535  N-acetylneuraminic acid mutarotase  24.49 
 
 
368 aa  43.9  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0287347  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04139  hypothetical protein  24.49 
 
 
368 aa  43.1  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5814  N-acetylneuraminic acid mutarotase  25.61 
 
 
368 aa  43.1  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.376687 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3688  Kelch repeat-containing protein  24.49 
 
 
368 aa  43.1  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04177  hypothetical protein  24.49 
 
 
368 aa  43.1  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.691491  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4909  N-acetylneuraminic acid mutarotase  24.49 
 
 
368 aa  42.4  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>